Maklumat

1.2: Sel- Bio Biokimia - Biologi

1.2: Sel- Bio Biokimia - Biologi


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

1.2: Sel- Bio Biokimia

Ijazah Doktor Falsafah (PhD) dalam bidang Biokimia dan Biologi Sel

Setelah menamatkan ijazah PhD dalam bidang Biokimia dan Biologi Sel, pelajar akan dapat:

  1. Membangunkan pengetahuan komprehensif tentang pencapaian dan teknik penyelidikan semasa dan lepas dalam biokimia dan biologi sel.
  2. Menunjukkan kemahiran menyelesaikan masalah dan pemikiran kritis secara bebas.
  3. Menunjukkan kemahiran komunikasi bertulis, lisan dan visual yang berkesan yang diperlukan untuk menyatakan penemuan dan kepentingan saintifik melalui penerbitan, seminar, dan tesis yang menerangkan penyelidikan bebas.

Biologi Sel

Biologi sel bertujuan untuk memahami struktur dan fungsi fisiologi sel individu, cara ia berinteraksi dengan persekitarannya, dan cara bilangan sel yang besar berkoordinasi antara satu sama lain untuk membentuk tisu dan organisma. Oleh itu, biologi sel adalah nadi kepada semua sains biologi dan kunci untuk memahami perkembangan dan perkembangan penyakit manusia.

Projek di jabatan kami ditujukan ke arah meneroka dan mentakrifkan laluan fisiologi, selular dan molekul utama yang mendorong percambahan dan pembezaan sel, isyarat, penghijrahan, metabolisme dan autophagy, dan banyak lagi - dan fokus utama kajian kami adalah untuk memahami punca asas luas -menyebarkan penyakit manusia termasuk kencing manis, kanser, keradangan dan fibrosis. Kami menggunakan sistem model yang berbeza untuk kajian kami, bermula daripada garisan sel dan kultur organotip kepada pelbagai model haiwan dan menggabungkan pendekatan eksperimen yang pelbagai termasuk pelbagai jenis ujian berasaskan sel, mikroskopi, biologi molekul, genetik dan genomik, biokimia, kejuruteraan genom dan dalam vivo pengajian. Maklumat lanjut mengenai projek individu boleh didapati di bawah pautan di bawah.

Fakulti menjalankan penyelidikan dalam bidang ini:

Mitosis, transkripsi, struktur kromatin

Litar isyarat protein G dalam asas molekul penyakit

Mekanisme fibrosis tisu, aneurisme aorta, dan mekanotransduksi

Metabolisme RNA semasa tekanan

Peraturan Genomik Metabolisme, Komunikasi Nuklear-Mitokondria

Penolong Profesor
Penyiasat, NEIDL

Peranan protease virus dalam membentuk interaksi hos virus

purinoreceptors, reseptor EGFR, pengimejan confocal, pembaikan luka, komunikasi sel dan migrasi

Sel Stem, Biologi Kanser, Perkembangan organ, isyarat laluan Hippo

Biokimia


Rujukan

Kumpulan Penyelidikan Percubaan Kawalan Diabetes dan Komplikasi. Kesan rawatan intensif diabetes terhadap perkembangan dan perkembangan komplikasi jangka panjang dalam diabetes mellitus yang bergantung kepada insulin. N. Inggeris. J. Med. 329, 977–986 (1993).

Kumpulan Kajian Diabetes Prospektif UK (UKPDS). Kawalan glukosa darah intensif dengan sulfonilurea atau insulin berbanding dengan rawatan konvensional dan risiko komplikasi pada pesakit diabetes jenis 2 (UKPDS 33). Lancet 352, 837–853 (1998).

Wei, M., Gaskill, S. P., Haffner, S. M. & Stern, M. P. Kesan diabetes dan tahap glikemia pada semua sebab dan kematian kardiovaskular. Kajian Jantung San Antonio. Penjagaan Diabetes 7, 1167–1172 (1998).

Ebara, T. et al. Katabolisme tertunda lipoprotein apoB-48 disebabkan oleh penurunan pengeluaran proteoglikan heparan sulfat dalam tikus diabetes. J. Clin. melabur. 105, 1807–1818 (2000).

Ginsberg, H. N. Rintangan insulin dan penyakit kardiovaskular. J. Clin. melabur. 106, 453–458 (2000).

Lusis, A. J. Atherosclerosis. alam semula jadi 407, 233–241 (2000).

Hsueh, W. A. ​​& Law, R. E. Kontinuum risiko kardiovaskular: implikasi rintangan insulin dan diabetes. Am. J. Med. 105, 4S–14S (1998).

Jiang, Z. Y. et al. Pencirian rintangan terpilih kepada isyarat insulin dalam vaskular tikus Zucker (fa/fa) obes. J. Clin. melabur. 104, 447–457 (1999).

Williams, S. B. et al. Hiperglikemia akut melemahkan vasodilasi yang bergantung kepada endothelium pada manusia dalam vivo. Peredaran 97, 1695–1701 (1998).

Du, X. L. et al. Pengeluaran berlebihan superoksida mitokondria yang disebabkan oleh hiperglikemia mengaktifkan laluan hexosamine dan mendorong ekspresi perencat-1 pengaktif plasminogen dengan meningkatkan glikosilasi Sp1. Proc. Natl Acad. Sci. USA 97, 12222–12226 (2000).

Temelkova-Kurktschiev, T. S. et al. Glukosa plasma pascacabaran dan lonjakan glisemik lebih kuat dikaitkan dengan aterosklerosis daripada tahap glukosa puasa atau HbA1c. Penjagaan Diabetes 12, 1830–1834 (2000).

Wilson, D. K., Bohren, K. M., Gabbay, K. H. & Quiocho, F. A. Tapak substrat gula yang tidak mungkin dalam 1.65 Struktur holoenzim aldose reduktase manusia yang terlibat dalam komplikasi diabetes. Sains 257, 81–84 (1992).

Xia, P., Kramer, R. M. & King, G. L. Pengenalpastian mekanisme perencatan Na,K-adenosine triphosphatase bv hiperglikemia yang melibatkan pengaktifan protein kinase C dan fosfolipase sitosolik A2. J. Clin. melabur. 96, 733–740 (1995).

Williamson, J. R. et al. Pseudohypoxia hiperglisemik dan komplikasi diabetes. kencing manis 42, 801–813 (1993).

Garcia Soriano, F. et al. Disfungsi endothelial diabetes: peranan poli (ADP-ribose) pengaktifan polimerase. Alam Semula Jadi Med. 7, 108–113 (2001).

Lee, A. Y. & Chung, S. S. Sumbangan laluan poliol kepada tekanan oksidatif dalam katarak diabetes. FASEB J. 13, 23–30 (1999).

Engerman, R. L., Kern, T. S. & Larson, M. E. Pengaliran saraf dan perencatan aldose reduktase selama 5 tahun diabetes atau galaktosemia pada anjing. Diabetologia 37, 141–144 (1994).

Kumpulan Penyelidikan Percubaan Retinopati Sorbinil. Percubaan rawak sorbinil, perencat aldose reduktase, dalam retinopati diabetik. Gerbang. Oftalmol. 108, 1234–1244 (1990).

Greene, D. A., Arezzo, J. C. & Brown, M. B. Kesan perencatan aldose reduktase pada pengaliran saraf dan morfometri dalam neuropati diabetik. Kumpulan Kajian Zenarestat. Neurologi 53, 580–591 (1999).

Stitt, A. W. et al. Produk akhir glikasi lanjutan (AGEs) disetempat bersama dengan reseptor AGE dalam vaskular retina pesakit kencing manis dan tikus yang diselitkan AGE. Am. J. Pathol. 150, 523–528 (1997).

Horie, K. et al. Kolokalisasi imunohistokimia produk glikooksidasi dan produk peroksidasi lipid dalam lesi glomerular renal diabetes. Implikasi untuk tekanan glikooksidatif dalam patogenesis nefropati diabetik. J. Clin. melabur. 100, 2995–2999 (1997).

Degenhardt, T. P., Thorpe, S. R. & Baynes, J. W. Pengubahsuaian kimia protein oleh methylglyoxal. Sel Mol. biol. 44, 1139–1145 (1998).

Wells-Knecht, K. J. et al. Mekanisme glikosilasi autoksidatif: pengenalpastian glioksal dan arabinosa sebagai perantara dalam pengubahsuaian autoksidatif protein oleh glukosa. Biokimia 34, 3702–3709 (1995).

Thornalley, P. J. Sistem glyoxalase: perkembangan baru ke arah pencirian fungsi laluan metabolik asas kepada kehidupan biologi. Biokim J. 269, 1–11 (1990).

Suzuki, K. et al. Ekspresi berlebihan aldehid reduktase melindungi sel PC12 daripada sitotoksisiti methylglyoxal atau 3-deoxyglucosone. J. Biokim. 123, 353–357 (1998).

Soulis-Liparota T., Cooper, M., Papazoglou, D., Clarke, B. & Jerums, G. Keterlambatan oleh aminoguanidine perkembangan albuminuria, pengembangan mesangial, dan pendarfluor tisu dalam tikus diabetes yang disebabkan oleh streptozocin. kencing manis 40, 1328–1334 (1991).

Nakamura, S. et al. Kemajuan nefropati dalam tikus diabetes spontan dihalang oleh OPB-9195, perencat novel glikasi lanjutan. kencing manis 46, 895–899 (1997).

Hammes, H-P. et al. Rawatan aminoguanidine menghalang perkembangan retinopati diabetik eksperimen. Proc. Natl Acad. Sci. USA 88, 11555–11559 (1991).

Giardino, I., Edelstein, D. & Brownlee, M. Glikosilasi nonenzimatik in vitro dan dalam sel endothelial bovine mengubah aktiviti faktor pertumbuhan fibroblas asas. Model untuk glikosilasi intraselular dalam diabetes. J. Clin. melabur. 94, 110–117 (1994).

Shinohara, M. et al. Ekspresi berlebihan glyoxalase-I dalam sel endothelial bovine menghalang pembentukan produk akhir glikasi lanjutan intraselular dan menghalang peningkatan yang disebabkan oleh hiperglikemia dalam endositosis makromolekul. J. Clin. melabur. 101, 1142–1147 (1998).

Maisonpierre, P. C. et al. Angiopoietin-2, antagonis semula jadi untuk Tie2 yang mengganggu angiogenesis in vivo. Sains 277, 55–60 (1997).

Tanaka, S., Avigad, G., Brodsky, B. & Eikenberry, E. F. Glycation mendorong pengembangan pembungkusan molekul kolagen. J. Mol. biol. 203, 495–505 (1988).

Huijberts, M. S. P. et al. Rawatan aminoguanidine meningkatkan keanjalan dan mengurangkan penapisan cecair arteri besar daripada tikus diabetes. J. Clin. melabur. 92, 1407–1411 (1993).

Tsilbary, E. C. et al. Kesan glukosilasi nonenzimatik pengikatan domain NC1 bukan kolagen utama kepada kolagen jenis IV. J. Biol. Kimia. 263, 4302–4308 (1990).

Charonis, A. S. et al. Perubahan laminin selepas glukosilasi nonenzimatik in vitro. kencing manis 39, 807–814 (1988).

Haitoglou, C. S., Tsilibary, E. C., Brownlee, M. & Charonis, A. S. Interaksi selular yang diubah antara sel endothelial dan kolagen laminin/jenis IV yang tidak berglukosilasi secara nonenzimatik. J. Biol. Kimia. 267, 12404–12407 (1992).

Federoff, H. J., Lawrence, D. & Brownlee, M. Glikosilasi nonenzimatik laminin dan peptida laminin CIKVAVS menghalang pertumbuhan neurit. kencing manis 42, 509–513 (1993).

Li, Y. M. et al. Identiti molekul dan pengedaran selular reseptor produk akhir glikasi lanjutan: hubungan p60 dengan OST-48 dan p90 hingga 80K-H protein membran. Proc. Natl Acad. Sci. USA 93, 11047–11052 (1996).

Smedsrod, B. et al. Produk akhir glikasi lanjutan disingkirkan oleh endositosis pengantara-pengantara reseptor dalam kupffer sinusoidal hepatik dan sel endothelial. Biokim J. 322, 567–573 (1997).

Vlassara, H. et al. Pengenalpastian galectin-3 sebagai protein pengikat pertalian tinggi untuk produk akhir glikasi lanjutan (AGE): ahli baharu kompleks reseptor AGE. Mol. Med. 1, 634–646 (1995).

Neeper, M. et al. Pengklonan dan ekspresi RAGE: reseptor permukaan sel untuk produk akhir glikosilasi lanjutan protein. J. Biol. Kimia. 267, 14998–15004 (1992).

Vlassara, H. et al. Cachectin / TNF dan IL-1 yang disebabkan oleh protein yang diubah suai glukosa: peranan dalam pembentukan semula tisu biasa. Sains 240, 1546–1548 (1988).

Kirstein, M., Aston, C., Hintz, R. & Vlassara, H. Induksi khusus reseptor bagi faktor pertumbuhan seperti insulin I dalam monosit manusia oleh protein diubah suai produk akhir glikosilasi lanjutan. J. Clin. melabur. 90, 439–446 (1992).

Abordo, E. A., Westwood, M. E. & Thornalley, P. J. Sintesis dan rembesan faktor perangsang koloni makrofaj oleh monosit manusia matang dan sel THP-1 monositik manusia yang disebabkan oleh derivatif albumin serum manusia yang diubah suai dengan produk akhir glikasi lanjutan metilglyoxal dan glukosa. Immunol. Lett. 53, 7–13 (1996).

Skolnik, E. Y. et al. Reseptor sel mesangial manusia dan tikus untuk protein yang diubah suai glukosa: peranan yang berpotensi dalam pembentukan semula tisu buah pinggang dan nefropati diabetik. J. Exp. Med. 174, 931–939 (1991).

Doi, T. et al. Peningkatan khusus reseptor dalam pengeluaran matriks ekstraselular dalam sel mesangial tetikus oleh produk akhir glikosilasi lanjutan diantarkan melalui faktor pertumbuhan terbitan platelet. Proc. Natl Acad. Sci. USA 89, 2873–2877 (1992).

Schmidt, A. M. et al. Produk akhir glikasi lanjutan yang berinteraksi dengan reseptor endothelial mereka mendorong ekspresi molekul-1 lekatan sel vaskular (VCAM-1) dalam sel endothelial manusia yang dikultur dan pada tikus: mekanisme yang berpotensi untuk vaskulopati diabetes yang dipercepatkan. J. Clin. melabur. 96, 1395–1403 (1995).

Lu, M. et al. Produk akhir glikasi lanjutan meningkatkan ekspresi faktor pertumbuhan endothelial vaskular retina. J. Clin. melabur. 101, 1219–1224 (1998).

Park, L. et al. Penindasan aterosklerosis diabetes dipercepatkan oleh reseptor larut untuk produk akhir glikasi lanjutan. Alam Semula Jadi Med. 4, 1025–1031 (1998).

Yan, S. D. et al. Tekanan oksidan selular dipertingkatkan dengan interaksi produk akhir glikasi lanjutan dengan reseptor/protein pengikatnya. J. Biol. Kimia. 269, 9889–9897 (1994).

Lander, H. M. et al. Pengaktifan reseptor untuk produk akhir glikasi lanjutan mencetuskan laluan kinase protein diaktifkan mitogen yang bergantung kepada p21(ras) yang dikawal oleh tekanan oksidan. J. Biol. Kimia. 272, 17810–17814 (1997).

Yamagishi, S. et al. Produk akhir glikasi lanjutan menghalang pengeluaran prostacyclin dan mendorong perencat-1 pengaktif plasminogen dalam sel endothelial mikrovaskular manusia. Diabetologia 41, 1435–1441 (1998).

Tsuji, H. et al. Penyasaran ribozim reseptor untuk produk akhir glikasi lanjutan dalam sel mesangial tetikus. Biokim. Biophys. Res. Commun. 245, 583–588 (1998).

Koya, D. & King, G. L. Pengaktifan protein kinase C dan perkembangan komplikasi diabetes. kencing manis 47, 859–866 (1998).

Xia, P. et al. Pencirian mekanisme untuk pengaktifan kronik laluan diacylglycerol-protein kinase C dalam diabetes dan hipergalaktosemia. kencing manis 43, 1122–1129 (1994).

Koya, D. et al. Pencirian pengaktifan isoform protein kinase C beta pada ekspresi gen mengubah faktor pertumbuhan-beta, komponen matriks ekstraselular, dan prostanoid dalam glomeruli tikus diabetes. J. Clin. melabur. 100, 115–126 (1997).

Portilla, D. et al. Enzim termodulat PPARalpha yang disebabkan oleh Etomoxir melindungi semasa kegagalan buah pinggang akut. Am. J. Physiol. Fisiol buah pinggang. 278, F667–F675 (2000).

Keogh, R. J., Dunlop, M. E. & Larkins R. G. . Kesan perencatan aldose reduktase pada fluks glukosa, pembentukan diasilgliserol, protein kinase C, dan pengaktifan fosfolipase A2. Metabolisme 46, 41–47 (1997).

Ishii, H. et al. Ameliorasi disfungsi vaskular dalam tikus diabetes oleh perencat beta PKC oral. Sains 272, 728–731 (1996).

Craven, P. A., Studer, R. K. & DeRubertis, F. R. Penjanaan guanosin monofosfat kitaran nitrik bergantung kepada oksida terjejas dalam glomeruli daripada tikus diabetes. Bukti untuk penindasan protein kinase C-mediated terhadap tindak balas kolinergik. J. Clin. melabur. 93, 311–320 (1994).

Ganz, M. B. & Seftel, A. Perubahan yang disebabkan oleh glukosa dalam protein kinase C dan nitrik oksida dihalang oleh vitamin E. Am. J. Physiol. 278, E146–E152 (2000).

Kuboki, K. et al. Peraturan ekspresi gen sintase nitrik oksida konstitutif endothelial dalam sel endothelial dan dalam vivo tindakan vaskular spesifik insulin. Peredaran 101, 676–681 (2000).

Glogowski, E. A., Tsiani, E., Zhou, X., Fantus, I. G. & Whiteside, C. Glukosa tinggi mengubah tindak balas isoform protein kinase C sel mesangial kepada endothelin-1. Buah Pinggang Int. 55, 486–499 (1999).

Hempel, A. et al. Kepekatan glukosa yang tinggi meningkatkan kebolehtelapan sel endothelial melalui pengaktifan protein kinase C alpha. Circ. Res. 81, 363–371 (1997).

Williams, B., Gallacher, B., Patel, H. & Orme, C. Pengaktifan kinase C protein yang disebabkan oleh glukosa mengawal ekspresi mRNA faktor kebolehtelapan vaskular dan pengeluaran peptida oleh sel otot licin vaskular manusia secara in vitro. kencing manis 46, 1497–1503 (1997).

Studer, R. K., Craven, P. A. & DeRubertis, F. R. Peranan untuk protein kinase C dalam pengantaraan peningkatan pengumpulan fibronektin oleh sel mesangial yang ditanam dalam medium glukosa tinggi. kencing manis 42, 118–126 (1993).

Koya, D. et al. Pencirian pengaktifan isoform protein kinase C beta pada ekspresi gen mengubah faktor pertumbuhan-beta, komponen matriks ekstraselular, dan prostanoid dalam glomeruli tikus diabetes. J. Clin. melabur. 100, 115–126 (1997).

Craven, P. A., Studer, R. K., Felder, J., Phillips, S. & DeRubertis, F. R. Perencatan oksida nitrik mengubah sintesis faktor pertumbuhan-beta dan kolagen dalam sel mesangial. kencing manis 46, 671–681 (1997).

Phillips, S. L., DeRubertis, F. R. & Craven, P. A. Peraturan penganjur laminin C1 dalam sel mesangial berbudaya. kencing manis 48, 2083–2089 (1999).

Feener, E. P. et al. Peranan protein kinase C dalam ekspresi perencat pengaktif plasminogen yang disebabkan oleh glukosa dan angiotensin II. Sumbang. Nephrol. 118, 180–187 (1996).

Pieper, G. M. & Riaz-ul-Haq, J. Pengaktifan faktor nuklear-kappaB dalam sel endothelial berbudaya dengan peningkatan kepekatan glukosa: pencegahan oleh calphostin C. Cardiovasc. Pharmacol. 30, 528–532 (1997).

Yerneni, K. K., Bai, W., Khan, B. V., Medford, R. M. & amp Natarajan, R. Hyperglycemia yang disebabkan oleh pengaktifan faktor transkripsi nuklear kappaB dalam sel otot licin vaskular. kencing manis 48, 855–864 (1999).

Koya, D. et al. Peningkatan pengembangan mesangial diabetes dipercepatkan dengan rawatan dengan perencat beta PKC dalam tikus db/db diabetes, model tikus untuk diabetes jenis 2. FASEB J. 14, 439–447 (2000).

Kolm-Litty, V., Sauer, U., Nerlich, A., Lehmann, R. & Schleicher, E. D. Pengeluaran beta1 faktor pertumbuhan berubah akibat glukosa tinggi dimediasi oleh laluan hexosamine dalam sel mesangial glomerular babi. J. Clin. melabur. 101, 160–169 (1998).

Marshall, S., Bacote, V. & Traxinger, R. R. Penemuan laluan metabolik yang mengantara penyahpekaan akibat glukosa bagi sistem pengangkutan glukosa. Peranan biosintesis hexosamine dalam induksi rintangan insulin. J. Biol. Kimia. 266, 4706–4712 (1991).

Hawkins, M. et al. Peranan laluan glukosamin dalam rintangan insulin yang disebabkan oleh lemak. J. Clin. melabur. 99, 2173–2182 (1997).

Chen, Y. Q. et al. Tapak Sp1 mengantara pengaktifan plasminogen activator inhibitor-1 promoter oleh glukosa dalam sel otot licin vaskular. J. Biol. Kimia. 273, 8225–8231 (1998).

Goldberg, H. J., Scholey, J. & Fantus, I. G. Glucosamine mengaktifkan plasminogen activator inhibitor 1 gen promoter melalui tapak pengikat DNA Sp1 dalam sel mesangial glomerular. kencing manis 49, 863–871 (2000).

Kadonaga, J. T., Courey, A. J., Ladika, J. & Tjian, R. Kawasan berbeza Sp1 memodulasi pengikatan DNA dan pengaktifan transkrip. Sains 242, 1566–1570 (1988).

Haltiwanger, RS, Grove, K. & Philipsberg, GA Modulasi paras N-asetilglukosamin berkaitan O pada protein nuklear dan sitoplasma dalam vivo menggunakan perencat O-GlcNAc-beta-N-acetylglucosaminidase O-(2-acetamido-2- peptida) deoksi-D-glucopyranosylidene)amino-N-fenilkarbamat. J. Biol. Kimia. 273, 3611–3617 (1998).

Hart, G. W. Glikosilasi berkaitan O Dinamik bagi protein nuklear dan sitoskeletal Annu. Rev. Biochem. 66, 315–335 (1997).

Du, X. D. et al. Hiperglisemia menghalang aktiviti sintase nitrik oksida endothelial dengan pengubahsuaian pasca translasi di tapak AKT. J. Clin. melabur. (dalam akhbar).

Lee, A. Y., Chung, S. K. & Chung, S. S. Demonstrasi bahawa pengumpulan poliol bertanggungjawab untuk katarak diabetes dengan menggunakan tikus transgenik yang menyatakan gen aldose reduktase dalam kanta. Proc. Natl Acad. Sci. USA 92, 2780–2784 (1995).

Nishikawa, T. et al. Menormalkan pengeluaran superoksida mitokondria menyekat tiga laluan kerosakan hiperglisemik. alam semula jadi 404, 787–790 (2000).

Giugliano, D., Ceriello, A. & Paolisso, G. Tekanan oksidatif dan komplikasi vaskular diabetes. Penjagaan Diabetes 19, 257–267 (1996).

Giardino, I., Edelstein, D. & Brownlee, M. BCL-2 ekspresi atau antioksidan menghalang pembentukan hiperglisemia yang disebabkan oleh produk akhir glikasi lanjutan intraselular dalam sel endothelial lembu. J. Clin. melabur. 97, 1422–1428 (1996).

Korshunov, S. S., Skulachev, V. P. & Starkov, A. A. Potensi protonik yang tinggi menggerakkan mekanisme penghasilan spesies oksigen reaktif dalam mitokondria. FEBS Lett. 416, 15–18 (1997).

Craven, R. P., Phillip, S. L., Melhem, M. F., Liachenko, J. & amp De Rubertis, F. R. Ekspresi berlebihan Mn 2+ superoxide dismutase menyekat peningkatan dalam pengumpulan kolagen yang disebabkan oleh budaya dalam sel measangial dalam glukosa media tinggi. Metabolisme (dalam akhbar).

Yamagishi, S. I., Edelstein, D., Du, X. L. & Brownlee, M. Hiperglisemia mempotensikan pengaktifan platelet yang disebabkan oleh kolagen melalui pengeluaran berlebihan superoksida mitokondria. kencing manis 50, 1491–1494 (2001).

Craven, P. A., Melham, M. F., Phillip, S. L. & DeRubertis, F. R. Ekspresi berlebihan Cu 2+ /Zn 2+ superoxide dismutase melindungi daripada kecederaan glomerular diabetes awal dalam tikus transgenik. kencing manis 50, 2114–2125 (2001).

Engerman, R. L. & Kern, T. S. Kemajuan retinopati diabetik permulaan semasa kawalan glisemik yang baik. kencing manis 36, 808–812 (1987).

Percubaan Kawalan Diabetes dan Komplikasi/Epidemiologi Kumpulan Penyelidikan Intervensi dan Komplikasi Diabetes. Retinopati dan nefropati pada pesakit diabetes jenis 1 empat tahun selepas percubaan terapi intensif. N. Inggeris. J. Med. 342, 381–389 (2000).

Quinn, M., Angelico, M. C., Warram, J. H. & Krolewski, A. S. Faktor keluarga menentukan perkembangan nefropati diabetik pada pesakit dengan IDDM. Diabetologia 39, 940–945 (1996).

Kumpulan Penyelidikan Percubaan Kawalan Diabetes dan Komplikasi. Pengelompokan komplikasi jangka panjang dalam keluarga yang menghidap diabetes dalam percubaan kawalan diabetes dan komplikasi. kencing manis 46, 1829–1839 (1997).

Wagenknecht, L. E. et al. Agregasi keluarga kalsium arteri koronari dalam keluarga dengan diabetes jenis 2. kencing manis 50, 861–866 (2001).

Kowluru, R. A., Tang, J. & Kern, T. S. Keabnormalan metabolisme retina dalam diabetes dan galaktosemia eksperimen. VII. Kesan pentadbiran jangka panjang antioksidan terhadap perkembangan retinopati. kencing manis 50, 1938–1942 (2001).

Ting, H. H. et al. Vitamin C meningkatkan vasodilasi yang bergantung kepada endothelium pada pesakit dengan diabetes mellitus yang tidak bergantung kepada insulin. J. Clin. melabur. 97, 22–28 (1996).

Penyiasat Kajian Penilaian Pencegahan Hasil Jantung. Kesan ramipril pada hasil kardiovaskular dan mikrovaskular pada orang yang menghidap diabetes mellitus: hasil kajian HOPE dan subkajian MICRO-HOPE. Lancet 355, 253–259 (2000).

Salvemini, D. et al. Tiruan nonpeptidil superoksida dismutase dengan aktiviti terapeutik dalam tikus. Sains 286, 304–306 (1999).

Coppey, L. J. et al. Brit. J. Pharmacol. 134, 21–29 (2001).


Sel menjadi tua sebagai tindak balas untuk mencapai had Hayflick pada replikasi, atau kepada mutasi yang berpotensi menjadi kanser, atau persekitaran toksik dan kerosakan sel akibatnya, atau isyarat daripada sel tua yang lain. Senescence secara nominal adalah keadaan yang tidak dapat dipulihkan. Replikasi terhenti dan sel mula merembeskan isyarat pro-radang untuk menarik perhatian sistem imun. Sel sensen biasanya dikeluarkan melalui kematian sel yang diprogramkan atau tindakan sel imun sitotoksik. Dengan usia, kadar penciptaan meningkat dan kadar penyingkiran menurun, bagaimanapun, membawa kepada peningkatan bilangan sel senescent di seluruh badan. Isyarat peningkatan bilangan sel senescent dalam tisu tua menyebabkan keradangan kronik dan mengganggu penyelenggaraan tisu, yang membawa kepada penyakit berkaitan usia.

Apa yang perlu dilakukan mengenai perkara ini? Kebanyakan tumpuan komuniti penyelidikan adalah pada pendekatan senolitik yang memaksa sel senescent ke dalam apoptosis dan pemusnahan diri, atau yang mencetuskan sistem imun kepada pembersihan sel senescent yang lebih cekap. Terapi ini telah mencapai hasil yang mengagumkan pada tikus, membalikkan penyakit berkaitan usia dan banyak ukuran penuaan. Sesetengah penyelidik berminat dengan pembalikan penuaan, bagaimanapun: memprogram semula sel dengan cara yang mengatasi proses pengawalseliaan yang biasanya memastikan kesinambungan keadaan tua.

Adakah pembalikan penuaan adalah idea yang baik? Nampaknya sekurang-kurangnya beberapa sel senescent adalah senescent untuk alasan yang baik. Bahawa mereka rosak, dan dalam beberapa kes kerosakan itu berpotensi menjadi kanser. Membalikkan penuaan mungkin menghasilkan keuntungan jangka pendek yang serupa dengan terapi senolitik, kerana dalam kedua-dua kes isyarat berbahaya yang dihasilkan oleh sel tua dialih keluar. Tetapi risiko kanser yang meningkat dengan ketara mungkin merupakan kos pendekatan itu.

Walaupun pengaturcaraan semula separa membuktikan bahawa sel senescent boleh dipulihkan, penamatan awal proses pengaturcaraan semula ini diketahui menyebabkan disregulasi epigenetik, mengakibatkan sel displastik yang tidak dibezakan seperti kanser buah pinggang. Oleh itu, strategi terapeutik baru tanpa batasan kritikal sedemikian sangat diperlukan. Penuaan selular disebabkan oleh interaksi kompleks antara biomolekul yang mengawal kitaran sel, tindak balas kerosakan DNA, metabolisme tenaga, dan rembesan sitokin. Kajian terbaru menunjukkan bahawa penuaan selular, yang sebelum ini dianggap sebagai fenomena biologi yang tidak dapat dipulihkan, boleh diterbalikkan, tetapi disebabkan oleh sifat interaksi kompleks sedemikian yang mengawal penuaan selular, mekanisme di mana penuaan selular boleh diterbalikkan belum didedahkan.

Penyelidik membina semula ensemble 5000 model rangkaian Boolean yang boleh mewakili fenotip penuaan, senyap dan percambahan dengan menyepadukan maklumat daripada literatur, pangkalan data rangkaian dan data tatasusunan fosfoprotein fibroblas kulit. Dalam model mereka, penuaan selular disebabkan oleh pengaktifan serentak isyarat kerosakan DNA (doxorubicin) dan isyarat pertumbuhan (IGF-1 plus serum). Mereka mengenal pasti 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1 (PDK1) sebagai sasaran protein optimum yang boleh mengembalikan penuaan kepada senyap dengan selamat sambil mengelakkan percambahan yang tidak terkawal, melalui analisis simulasi komputer yang meluas bagi model ensemble. PDK1 membentuk struktur maklum balas positif bersama-sama dengan AKT, IKBKB, dan PTEN, yang secara serentak mengawal kedua-dua faktor nuklear κB, yang mengawal rembesan sitokin, dan mTOR, yang mengawal pertumbuhan sel.

Untuk mengesahkan keputusan simulasi, penyelidik menjalankan eksperimen in vitro dan mengesahkan bahawa apabila PDK1 dihalang, pelbagai penanda penuaan selular dikembalikan kepada normal dan potensi percambahan dipulihkan. Daripada ujian penyembuhan luka dan eksperimen tisu kulit yang dibina semula 3D, mereka juga mengesahkan bahawa sel yang dipulihkan dapat bertindak balas dengan sewajarnya kepada rangsangan luar. Khususnya, dengan memerhati fibroblas dermal dalam dermis bersama keratinosit dalam epidermis, eksperimen tisu kulit yang dibina semula 3D mengesahkan bahawa perencatan PDK1 menggalakkan pembaharuan epidermis dan memulihkan ketebalan kulit, mengakibatkan pembalikan degenerasi kulit yang berkaitan dengan usia.

Sebatian daripada Sumber Semula Jadi sebagai Perencat Protein Kinase

Fisetin ditunjukkan dalam Rajah 1 sebagai perencat PDK1. Diet yang kaya dengan polifenol tumbuhan mungkin merupakan idea yang baik.

Apakah tumpuan penyelidikan senolitik anda?

Terdapat asid lemak khusus yang dibuat dalam jumlah kecil dalam badan dipanggil asid dihomo-gamma-linoleik atau DGLA. Ia juga terdapat dalam jumlah kecil dalam diet. Apabila saya memberi tikus berumur dalam jumlah yang lebih besar DGLA, mereka berubah daripada mempunyai beberapa sel tua kepada mempunyai lebih sedikit.

Ini membentangkan sasaran terapeutik baru. Saya mengenal pasti kompaun calon menggunakan laluan metabolik DGLA yang berfungsi pada dos yang lebih 1,000 kali lebih rendah daripada fisetin, jadi anda boleh bayangkan kami agak teruja dengan keputusan ini.

Seperti banyak penemuan bioperubatan, ia adalah tidak sengaja. DGLA membuat lipid anti-radang, yang membantu mengurangkan keadaan seperti arthritis rheumatoid. Saya sedang mengkaji aspek DGLA ini apabila saya terkejut apabila mendapati ia membunuh sel senescent.

Kerja saya masih dalam peringkat awal, dan kami hanya mengkaji sebilangan kecil tikus, jadi terlalu awal untuk membuat kesimpulan sementara, walaupun saya jelas gembira kerana kami telah melihat penghapusan sejumlah besar sel senescent. pada tikus tua. Kami akan memantau dengan teliti kesan positif DGLA serta sebarang kesan negatif terhadap tikus.

Bagaimanakah DGLA akan diberikan kepada orang ramai?

Kami berada beberapa tahun dari itu, kerana segala-galanya harus sempurna dengan tikus sebelum kita memikirkan tentang percubaan dengan manusia.

Pertama, kita perlu memikirkan bagaimana DGLA membunuh sel senescent pada tikus. Sekali lagi, tidak semua kajian dengan tikus memberikan hasil yang sama pada manusia, jadi kami sangat berhati-hati tentang cara kami menyampaikan penemuan kami dan kemungkinan tindakan masa depan.

Tetapi berada di HNRCA, saya telah bertemu dengan penyelidik USDA dan saintis pemakanan, dan mendapati bahawa sesetengah daripada mereka sedang membangunkan kacang soya yang diperkaya dengan DGLA. Dalam satu senario, anda mungkin keluar untuk sushi dan mendapatkan semangkuk kecil edamame yang diperkaya DGLA sebagai sampingan. Apabila anda selesai makan, anda telah membantu mengurangkan kemungkinan mendapat beberapa patologi berkaitan usia.

Saya tidak tahu sama ada ia akan berfungsi seperti itu, tetapi ini adalah idea yang sedang kami usahakan. Saya juga sedang mengusahakan terapi yang meningkatkan jumlah DGLA yang berlaku secara semula jadi dalam sel senescent yang saya sangat teruja, jadi ini akan menjadi pendekatan alternatif.

Anda juga sedang mengkaji cara untuk menguji terapi senolitik di luar langkah seperti peningkatan dalam jarak berjalan, bukan?

Ya, saya sedang membangunkan ujian cepat dan mudah untuk mengetahui sama ada terapi senolitik berfungsi. Ujian untuk keberkesanan senolitik tidak benar-benar dilakukan sekarang-anda hanya mencari peningkatan dalam gejala atau fungsi dan pada dasarnya membuat kesimpulan bahawa ia disebabkan oleh terapi.

Tetapi kita tidak boleh mengatakannya dengan penuh keyakinan. Pada masa ini, penyelidik mendapatkan sampel kulit atau lemak daripada pesakit dalam ujian ini sebelum dan selepas rawatan senolitik untuk mencari sel senescent. Tetapi ini adalah prosedur invasif dan amat mencabar bagi orang yang lebih tua untuk menjalani ujian ini.

Satu cara untuk menyelesaikan dilema ini ialah mengenal pasti biomarker, sebatian boleh diukur yang secara konsisten dan boleh dipercayai boleh mengesahkan keberkesanan intervensi. Sebagai contoh, kita tahu bahawa lipid tertentu, dihomo-15d-PGJ2, terkumpul dalam jumlah yang besar di dalam sel senescent.

Apabila kita memberikan terapi senolitik yang membunuh sel-sel ini dalam tikus atau sel manusia, lipid ini dibebaskan. Mengesannya dalam darah dan air kencing adalah jauh kurang invasif, jadi itulah yang saya sedang usahakan sekarang. Matlamat kami adalah untuk dapat menguji orang yang menerima terapi senolitik untuk kehadiran dihomo-15d-PGJ2 dalam darah dan air kencing mereka menjelang akhir musim panas.


Keperluan Pra-Major

Program Sains Biologi di Sacramento State adalah salah satu program yang paling dicari di California Utara. Disebabkan bilangan permohonan yang banyak, program ini kini terjejas secara rasmi. Pelajar yang ingin menjadi jurusan Sains Biologi mesti melengkapkan satu siri bahagian bawah yang diperlukan dan kemudian mesti memohon kemasukan ke program tersebut. Semak tapak web jabatan untuk keperluan, dan amat disyorkan bahawa pelajar yang berminat bercakap dengan penasihat di Pusat Penasihat Sains Semula Jadi (NSAC) secepat mungkin.

Pelajar baru yang berminat dalam jurusan tersebut diterima sebagai jurusan pra-Biologi Sains.

Untuk menukar kepada jurusan Sains Biologi, pelajar pra-utama dikehendaki melengkapkan kursus dan keperluan gred berikut dan menyerahkan borang Pengisytiharan Major kepada Pejabat Jabatan Sains Biologi bersama-sama dengan salinan transkrip.


Keperluan untuk Minor dalam Biokimia dan Biologi Sel

Pelajar yang mengikuti minor dalam Biokimia dan Biologi Sel mesti melengkapkan:

Minimum dalam Biokimia dan Biologi Sel ditujukan untuk mereka yang mempunyai minat dalam sains hayat tetapi yang mungkin mengambil jurusan dalam bidang lain. Pelajar kecil ini menggabungkan banyak kursus teras sains hayat yang diperlukan untuk profesion kesihatan.

Kursus-kursus yang disenaraikan di bawah memenuhi keperluan untuk minor ini. Dalam keadaan tertentu, kursus yang tiada dalam senarai rasmi ini boleh digantikan setelah mendapat kelulusan penasihat akademik bawah umur, atau jika berkenaan, Pengarah Program. (Penggantian kursus mesti dipohon secara rasmi dan dimasukkan ke dalam Ijazah Kerja oleh Pengesah Rasmi di bawah umur). Pelajar dan penasihat akademik mereka harus mengenal pasti dan mendokumentasikan dengan jelas kursus yang akan diambil.

Ringkasan

Senarai Kursus
Kod Tajuk Jam kredit
Jumlah Jam Kredit Diperlukan untuk Minor dalam Biokimia dan Biologi Sel Minimum 44

Keperluan Kecil

Nota kaki dan Maklumat Tambahan

Penggantian yang dibenarkan: MATH 105 atau MATH 111 dan MATH 112 boleh digantikan dengan MATH 101 MATH 106 boleh digantikan dengan MATH 102 CHEM 151 boleh digantikan dengan CHEM 121 atau CHEM 111 CHEM 153 boleh digantikan dengan CHEM 123 atau CHEM 1. CHEM 122 atau CHEM 112 , dan CHEM 154 boleh digantikan dengan CHEM 124 atau CHEM 114 CHEM 320 boleh digantikan dengan CHEM 212 PHYS 101 dan PHYS 103 atau PHYS 111 boleh digantikan dengan PHYS 102 PHYS 102 dan41 digantikan dengan PHYS 126 .

Kursus kuliah dicatatkan dalam Katalog Kursus Beras dengan jenis kursus "lecture". Kursus ini tidak termasuk kursus yang disenaraikan dengan jenis kursus "kuliah/makmal".


Kuliah 3: Biokimia 2

Muat turun trek daripada iTunes U atau Arkib Internet.

Topik yang diliputi: Biokimia 2

Pengajar: Prof Robert A. Weinberg

Kuliah 10: Biolo Molekul.

Kuliah 11: Biolo Molekul.

Kuliah 12: Biolo Molekul.

Kuliah 13: Peraturan Gen

Kuliah 14: Protein Localiz.

Kuliah 15: DNA Rekombinan 1

Kuliah 16: DNA Rekombinan 2

Kuliah 17: DNA Rekombinan 3

Kuliah 18: DNA Rekombinan 4

Kuliah 19: Kitaran Sel/Tanda.

Kuliah 26: Sistem Saraf 1

Kuliah 27: Sistem Saraf 2

Kuliah 28: Sistem Saraf 3

Kuliah 29: Sel Stem/Klon.

Kuliah 30: Sel Stem/Klon.

Kuliah 31: Perubatan Molekul.

Kuliah 32: Evolu Molekul.

Kuliah 33: Perubatan Molekul.

Kuliah 34: Polimorf Manusia.

Kuliah 35: Polimorf Manusia.

Selamat Pagi kelas. Gembira dapat berjumpa lagi. Semoga anda mempunyai hujung minggu yang hebat. Jika anda tidak melakukannya, ia bukan kerana cuaca.

Jadi di sini saya, sekali lagi ahli berjalan yang cedera, dan kita bercakap tentang karbohidrat hari ini, seperti yang anda ingat, atau sekurang-kurangnya kita berada di penghujung perbincangan kita kali terakhir.

Dan, kami menegaskan bahawa kumpulan hidroksil berbilang pada karbohidrat ini, dalam satu tangan, menentukan identiti pelbagai jenis gula.

Hanya orientasi, orientasi tiga dimensi mereka, untuk satu perkara, dan untuk satu lagi bahawa kumpulan hidroksil berbilang ini mewakili peluang untuk membentuk ikatan kovalen dengan monosakarida lain seperti yang ditunjukkan di sini dalam disakarida ini, atau ikatan kovalen hujung ke hujung. untuk mencipta molekul besar, yang akan semakin menjadi tema perbincangan kita hari ini, iaitu apabila saya bercakap tentang molekul besar, kita hanya menggunakan frasa secara umum, makromolekul, kerana pada dasarnya ini penggabungan hujung ke hujung molekul yang melibatkan dehidrasi dan pembentukan. daripada ikatan kovalen seperti di sini boleh mencipta molekul yang beratus-ratus, malah beribu-ribu subunit panjang.

Jadi, di sini, jika kita bercakap tentang polimer, kita merujuk kepada setiap satu daripada subunit polimer ini sebagai monomer, dan agregat secara keseluruhan sebagai polimer.

Di sini, kami menyentuh fakta menjelang penghujung kuliah yang lalu, sebenarnya, pada penghujungnya, seseorang itu boleh memaut silang rantaian karbohidrat yang panjang dan linear ini.

Dan di sini, kita melihat fakta bahawa glikogen, yang merupakan bentuk glukosa yang disimpan dalam hati kita sebahagian besarnya, dan sedikit sebanyak dalam otot sebenarnya adalah bercabang silang. Jadi, jika seseorang melukis molekul glikogen pada skala yang lebih kecil, seseorang mungkin melukis gambar yang kelihatan seperti ini.

Dan ia kelihatan hampir seperti pokok Krismas dengan berbilang cawangan.

Dan, tujuan ini sebenarnya adalah untuk mengasingkan glukosa, untuk menyimpan glukosa ke dalam bentuk metabolik yang tidak aktif sehingga tiba masanya organisma memerlukan, sekali lagi, tenaga yang tersimpan dalam glukosa di mana ikatan ini dipecahkan dengan cepat. dan glukosa digerakkan dan dimasukkan ke dalam peredaran untuk pelupusan dan penggunaan akhirnya dalam tisu tertentu yang tertentu.

Walaupun ia dibebani dalam polimer berat molekul tinggi ini, glukosa pada dasarnya tidak aktif secara metabolik.

Badan tak sedar dah ada.

Dan, kita boleh, sebagai akibatnya menyimpan sejumlah besar tenaga dalam molekul glikogen ini.

Dan ia boleh disimpan di sana selama-lamanya.

Sekarang, hakikatnya ialah idea pempolimeran hujung-ke-hujung yang baru saya nyatakan ini boleh diperluaskan kepada makromolekul lain yang juga dihubungkan hujung-ke-hujung dalam jenis polimer tertentu.

Dan di sini, kita bergerak, sekarang, ke dalam tanggapan bercakap tentang asid amino.

Dan, kita bercakap tentang protein.

Jika kita melihat asid amino, apa yang kita lihat ia mempunyai struktur penting seperti ini.

Inilah karbon pusat? kerana, pada dasarnya, rantai sisi yang berbeza di mana R mewakili beberapa rantai sisi yang boleh menjadi salah satu daripada, seperti yang akan kita lihat sebentar lagi, 20 identiti berbeza.

Tetapi, semua asid amino berkongsi sifat yang sama bahawa mereka mempunyai struktur keseluruhan ini.

Dan, seperti yang anda ingat daripada perbincangan kami minggu lepas, pada pH neutral, asid amino seperti ini, apa pun R, tidak akan kelihatan seperti ini sama sekali kerana kumpulan amina akan menarik proton tambahan, menyebabkan ia menjadi bercas positif.

Dan, kumpulan karboksil akan melepaskan proton, menyebabkan ia menjadi bercas negatif.

Dan, seperti yang anda boleh simpulkan daripada ini, pada pHn yang sangat rendah disebabkan oleh peningkatan kepekatan proton, proton bebas dalam larutan, keseimbangan akan lebih terdorong untuk mengikat semula proton kepada kumpulan karboksil hanya kerana terdapat begitu banyak. daripada proton ini di sekeliling.

Sebaliknya, pada pH yang sangat tinggi, di mana ion hidroksil berada dalam dominasi, mereka jelas cenderung untuk mengais proton, mengurangkan tahap proton ke tahap yang sangat rendah di dalam air.

Dan, dalam keadaan pH yang sangat tinggi, proton ini akan dilepaskan dan ditarik oleh ion hidroksil menyebabkan kumpulan amina ini sekali lagi kembali kepada keadaan cas negatifnya.

Sekarang, hakikatnya ialah asid amino ini wujud dalam konfigurasi tiga dimensi yang sangat spesifik.

Dan itu digambarkan dengan lebih baik di sini daripada yang saya boleh lukis di papan, yang dalam apa jua keadaan akan menjadi sia-sia.

Dan, anda boleh melihat prinsip bahawa sebaik sahaja anda mempunyai empat kumpulan sampingan berbeza yang keluar daripada karbon, pada dasarnya terdapat dua cara berbeza untuk menciptanya.

Dan, ini kadang-kadang dipanggil chirality.

Chiral, anda lihat, adalah borang di sini.

Jika saya cuba, seberapa banyak yang saya mahu, untuk meletakkan satu tangan di atas tangan yang lain.

Ia tidak berfungsi kerana ia adalah imej cermin antara satu sama lain, yang tidak simetri.

Dan, sebagai akibatnya, kita melihat jenis hubungan yang sama berlaku di sini di mana kita melihat bahawa kedua-dua bentuk asid amino ini, pada dasarnya, boleh wujud.

Dan, mereka tidak boleh ditukar ganti melainkan seseorang memecahkan salah satu ikatan dan memperbaharuinya.

Kedua-dua bentuk ini dipanggil L dan D, dan ternyata bentuk L ialah bentuk yang digunakan oleh hampir semua bentuk kehidupan di planet ini, iaitu terdapat pilihan sewenang-wenangnya dibuat kira-kira 3 bilion tahun yang lalu atau lebih untuk digunakan. salah satu daripada konfigurasi tiga dimensi, dan tidak menggunakan yang lain.

Yang lain ditemui dalam pengecualian tertentu yang jarang berlaku, tetapi hampir semua bentuk kehidupan di planet ini menggunakan bentuk L.

Bagaimanapun, ini menunjukkan beberapa keputusan sewenang-wenangnya yang dibuat awal semasa evolusi kerana kita boleh membayangkan di planet lain jika kehidupan wujud di sana dan ia bergantung kepada asid amino, dan sistem evolusi itu mungkin telah memilih bentuk D.

Jadi, ini adalah semacam nasib cabutan.

Ini sebenarnya adalah cara perkara berkembang di sini.

Dan, apa yang kita mula lihat, sekarang, adalah jika kita bercakap tentang protein atau jika kita mahu menjadi lebih spesifik dan menggunakan istilah yang lebih biokimia ?polipeptida,? kita melihat sekali lagi kita mempunyai sistem penyambungan hujung ke hujung yang sedikit berbeza daripada yang digunakan oleh monosakarida untuk mencipta rantai panjang glikogen atau kanji kerana di sini kita melihat sekali lagi tindak balas dehidrasi di mana kumpulan amina dan karboksil. kumpulan disebabkan untuk menumpahkan hidroksil dan proton, menyebabkan pembentukan ikatan peptida.

Dan di sini, kita melihat entiti biokimia yang penting dan sangat penting ini, ikatan peptida yang terdiri daripada karbonil ini dan nitrogen ini bergabung dengan cara khusus ini.

Dan, sudah tentu, jika anda mengenali ini sebagai ikatan peptida, maka anda boleh memahami mengapa protein kadangkala diberi istilah ?polipeptida.?

Dalam sesetengah kes, jika seseorang mempunyai regangan asid amino yang sangat pendek yang dihubungkan hujung ke hujung seperti ini, kita bercakap tentang ini sebagai oligopeptida, di mana ?oligo? ialah istilah umum yang digunakan dalam biologi untuk merujuk kepada sebilangan kecil perkara dan bukannya sebilangan besar perkara.

Dan, sekali lagi, kami mempunyai, di sini, kemungkinan untuk melanjutkan ini tanpa terhingga. Tiada kekangan, pada dasarnya, untuk membuat 500, 1,000, malah 2,000 asid amino ini panjang, di mana setiap satu daripada ini, sekali lagi, adalah asid amino, dan sekali lagi saya berasa sangat malu tentang identiti R1 dan R2, yang, seperti yang akan saya nyatakan sebentar lagi, boleh menjadi salah satu daripada 20 alternatif yang berbeza.

Di sini, anda melihat bahawa kami meneruskan proses pembentukan ikatan peptida ini.

Dan yang paling penting di sini ialah kesedaran bahawa terdapat polariti pemanjangan di sini.

Ia tidak bergerak dengan kebarangkalian yang sama kiri atau kanan, atau kanan ke kiri.

Kita bermula di hujung amino di sini.

Ini adalah hujung amino, dan ini adalah hujung karboksil.

Hujung amino dan hujung karboksil, dan selalunya, sekali lagi kerana cara kehidupan telah berkembang di planet ini, asid amino baharu ditambah pada hujung karboksil.

Oleh itu, apabila seseorang sering bercakap tentang protein, seseorang merujuk kepada terminal N mereka, dan ke hujung terminal C mereka, ini merujuk dengan jelas kepada kumpulan amino pada satu hujung dan karboksil dan pada hujung yang lain supaya polariti sentiasa sintesis terarah. menambahkannya pada hujung terminal-C, dengan kata lain untuk menggunakan tatatanda tangan pendek, kita berfikir tentang protein sebagai pergi dengan kekutuban N ini ke arah C.

Perkara berkembang di hujung terminal C secara progresif.

Dan, setiap kali seseorang boleh membayangkan penambahan asid amino pada hujungnya.

Jadi, sekali lagi, ia boleh dilanjutkan, pada dasarnya, selama-lamanya.

Perlu diingat juga, sesuatu yang tersirat dalam semua yang saya beritahu anda tetapi saya tidak akan selalu menyebutnya secara eksplisit, dan hampir setiap tindak balas biokimia boleh diterbalikkan.

Dan oleh itu, jika seseorang itu dapat membentuk ikatan peptida, seseorang itu mampu memecahkannya dengan cara biologi juga, iaitu dengan memasukkan molekul air kembali ke dalam dan dengan itu menggunakan proses hidrolisis, iaitu pemecahan ikatan melalui pengenalan molekul air untuk memusnahkan ikatan yang dicipta sebelum ini.

Untuk menggunakan frasa MIT, kebolehbalikan adalah jelas secara intuitif kerana jika anda dapat membuat, saya tidak tahu sama ada ia masih digunakan, tetapi ia digunakan pada Zaman Batu lewat di sekitar sini.

Bagaimanapun, sebarang tindakan biokimia mesti boleh diterbalikkan kerana jika, sebagai contoh, pempolimeran ini tidak boleh diterbalikkan, maka semua protein yang pernah disintesis di permukaan planet dalam tempoh 3 1/2 bilion tahun yang lalu akan terkumpul secara progresif.

Dan jelas, itu tidak berlaku.

Dan oleh itu, sintesis makromolekul, setakat ia bergerak ke hadapan, jelas mesti pergi ke arah lain juga.

Dan kepekatan protein lengkap yang terhasil dikenali sebagai keadaan mantapnya.

Jadi kita mungkin membuat protein pada satu kadar dan memecahkannya pada kadar yang sama.

Dan kepekatan keadaan mantapnya mewakili kompromi antara kedua-dua ini, iaitu, kepekatan protein sedemikian yang mungkin kita perhatikan pada satu-satu masa.

Memang istilah ?steady-state? boleh dikembangkan kepada mana-mana proses yang terdapat sintesis dan terdapat pecahan sesuatu.

Dan kepekatan keseimbangan yang terhasil, sekali lagi, dipanggil keadaan mantap molekul itu. Sekarang, mari kita turun ke perkara-perkara kecil, yang jelas merupakan sesuatu yang tidak boleh kita elakkan untuk masa yang lama, iaitu R's, iaitu rantai sisi.

Sekali lagi, di sini kita melihat artifak sewenang-wenang evolusi yang sangat awal dalam biosfera kerana terdapat, sebenarnya, 20 rantai sampingan yang berbeza menghasilkan 20 asid amino yang berbeza, yang digunakan dalam protein oleh semua organisma di planet ini.

Sekali lagi, terdapat pengecualian yang jarang berlaku, kulat tertentu dan bakteria tertentu mampu membuat asid amino yang luar biasa.

Tetapi ini adalah blok bangunan asas hampir semua bentuk kehidupan di planet ini. 99.99% daripada semua protein yang dicipta disintesis melalui pempolimeran 20 asid amino ini.

Dan, dengan cara ini, salah satu asid amino, glisin, di sini, anda lihat di sini, melanggar peraturan kiraliti ini.

Dan, anda akan ingat sebelum saya mengatakan bahawa kerana terdapat empat asid amino yang berbeza, empat rantai sampingan yang berbeza di sekeliling karbon pusat kadang-kadang dipanggil karbon alfa, anda sentiasa mempunyai kebolehan asid amino.

Tetapi tanggapan ini tidak boleh dihormati dalam kes glisin yang dilihat di sini semata-mata kerana kita tidak mempunyai empat yang berbeza, inilah karbon pusat yang saya tunjuk dengan merah, dan di sini kedua-dua hidrogen ini bersamaan antara satu sama lain.

Mereka bukan empat rantai yang berbeza.

Terdapat hanya tiga rantaian yang berbeza di sini.

Jadi glisin melanggar peraturan kiraliti ini, tangan kiri dan kanan. Dan di sini, omong-omong, rantai sisi, yang dalam semua kes ini digambarkan sebagai memanjang ke kanan setiap asid amino, rantai sisi hanyalah H, hanya proton, atom hidrogen.

Sebenarnya, apa yang kita lihat tentang asid amino ini ialah rantai sampingan mempunyai sifat biokimia yang agak berbeza.

Dan itu mula menarik perhatian kita dengan tanggapan bahawa protein dan sifat biokimianya boleh ditentukan oleh identiti asid amino yang digunakan untuk membinanya.

Kita boleh bercakap tentang tanggapan asid amino nonpolar berbanding polar, iaitu, asid amino yang mempunyai pertalian yang lemah dengan air.

Mereka tidak mempunyai pemisahan caj tambah dan tolak.

Dan sebagai akibatnya, mereka sedikit atau agak hidrofobik.

Sekarang, anda akan berkata, baik, bagaimana mereka boleh menjadi hidrofobik, kerana di sini oksigen ini dikenakan, dan di sini kumpulan amina ini dikenakan? Itu akan menjadikannya sangat hidrofilik.

Tetapi perlu diingat, apabila saya bercakap tentang asid amino ini, saya tidak bercakap tentang mereka apabila ia berada dalam satu bentuk asid amino.

Saya bercakap tentang sifat mereka sebaik sahaja mereka telah dipolimerkan menjadi keadaan seperti ini.

Dan, apabila ia dipolimerkan menjadi keadaan seperti ini, pengecasan NH2 dan CO, iaitu, cas di sini dan cas di sini menjadi tidak relevan kerana oksigen dan kumpulan amina ini kedua-duanya terikat dalam ikatan kovalen.

Dan, pemerolehan proton dan penumpahan proton ini tidak boleh berlaku, kerana kedua-dua atom ini, O dan N, terlibat dalam ikatan kovalen.

Oleh itu, apabila kita bercakap tentang asid amino nonpolar dan polar, perlu diingat bahawa kita memberi tumpuan kepada sifat biokimia rantai sampingan kerana tulang belakang pusat polipeptida dan tulang belakang pusat ditakrifkan dengan jelas di sini.

Berikut ialah tulang belakang tengah, dan anda lihat ia mempunyai struktur yang agak berulang, N, C, C, N, C, C, N, C, C, ini tidak berubah.

Apa yang berubah, dan apa yang mentakrifkan sifat biokimia oligopeptida ini, atau polipeptida, ialah identiti rantai sampingan ini, yang sekali lagi diplot pada graf tertentu ini.

Anda mempunyai versi yang berbeza dalam buku anda di sebelah kanan.

Di sini, anda lihat, kita mempunyai proton, kumpulan metil, valine, lucine, isolucine, dan perbezaan antara ini menunjukkan bahawa ini semua agak alifatik, agak serupa dengan propana yang kita bincangkan lepas, atau heksana. .

Maksudnya, ini adalah kumpulan sampingan yang agak hidrofobik.

Dan, oleh itu, jika terdapat polipeptida, kita boleh bayangkan, dan anda meletakkan polipeptida di dalam air, anda boleh bayangkan bahawa asid amino ini tidak mahu secara langsung berhadapan dengan air kerana fakta bahawa ia adalah hidrofobik.

Methionine juga agak hidrofobik.

Saya meragui di sana kerana S mempunyai tahap hidrofilik yang sedikit.

Ia mempunyai tahap kekutuban yang sedikit, tetapi tidak begitu banyak.

Dan, rantai sisi aromatik ini di sini, kerana mereka mempunyai cincin benzena ini, akibatnya dipanggil aromatik.

Ini adalah hidrofobik yang kuat.

Jadi, mereka sangat benci untuk berada dalam hubungan intim dengan air.

Di sini, sebaliknya, mari kita lihat rantai sampingan ini kerana di sini kita mempunyai molekul yang sangat polar, rantai sisi lagi.

Perlu diingat bahawa kami memberi tumpuan kepada rantai sisi.

Di sini kita melihat serine dengan kumpulan hidroksil yang boleh membentuk ikatan hidrogen dengan air, treonine, yang mempunyai kumpulan hidroksil sendiri, asparagine, yang mempunyai dua atom di sini, karbonil ini dan NH2, yang kedua-duanya boleh membentuk ikatan hidrogen dengan air. , begitu juga glutamin.

Jadi, ini agak hidrofilik.

Mereka tidak begitu fanatik hidrofilik seperti molekul caj ini di mana rantai sampingan bukan sahaja mampu membentuk ikatan hidrogen.

Dalam kumpulan yang lebih rendah di sini, rantai sisi mampu menjalani pengionan.

Jadi mereka sebenarnya didakwa dengan kuat.

Dan di sini, kita lihat di sini kumpulan karboksil, dan asid aspartik dan asid glutamat kita sebenarnya telah mengeluarkan protonnya, menjadi bercas negatif.

Ini adalah asid amino berasid, berdasarkan kumpulan karboksil yang mereka ada, asid amino asas di sini: arginin, lisin, dan histidin, semuanya memperoleh rantai sampingan bercas positif berdasarkan nitrogen ini di sini yang mempunyai pertalian kuat untuk menarik keluar proton atau mengabstraksi proton daripada pelarut berair.

Oleh itu, kita mempunyai kecerunan keseluruhan hidrofilik kepada hidrofobik.

Dan di sini, kami mempunyai struktur perantaraan.

Kami juga mempunyai beberapa jenis asid amino idiosinkratik yang sangat istimewa.

Ini adalah tirosin, dan tirosin sedikit lagi skizofrenia.

Ia mempunyai kumpulan aromatik yang sangat hidrofobik di sini, cincin benzena, yang tidak suka berada di dalam air, dan kumpulan hidroksil yang sebenarnya adalah kawan air.

Jadi, di sini, kita mempunyai sesuatu yang peranannya agak samar-samar.

Di sini, kami mempunyai sistin, seperti yang ditunjukkan di sini, dan apa yang menarik tentang kumpulan sistin dalam kes ini ialah kumpulan SH, rantai sisi, kumpulan SH, kerana kumpulan SH ini mampu membentuk ikatan dengan kumpulan SH lain daripada sistin lain. .

Jadi, mari kita lihat cystine di sini sebentar.

Anda lihat ada CH2, dan kemudian ada SH.

Jadi, mari kita bayangkan, saya tidak akan melukis semua atom di sini, tetapi mari bayangkan di sini kita mempunyai kumpulan CH2.

Saya tidak melukis tulang belakang, SH, di sini.

Dan, kita boleh bayangkan satu lagi rantai protein, satu lagi rantai polipeptida di bawah sini.

Sekali lagi, saya tidak melukis tulang belakang, tetapi saya melukis SH lain seperti ini.

Dan, hakikatnya, di bawah keadaan pengoksidaan dan pengurangan yang beroperasi sekurang-kurangnya dalam ruang ekstraselular, seseorang boleh mengoksidakan ini, kedua-dua ini, mengakibatkan pembentukan apa yang dikenali sebagai ikatan disulfida.

Jadi, di sini, kita sekarang mempunyai idea pertama bahawa rantai polipeptida boleh dikaitkan secara kovalen antara satu sama lain melalui pautan silang ini, seperti yang ditunjukkan di sini.

Sebaliknya, jika anda menambah agen pengurangan yang akan menambah proton kembali kepada ini, dan mengurangkan keadaan pengoksidaan sulfur, sekali lagi menyebabkan ikatan disulfida runtuh.

Sekarang, pada dasarnya, ikatan disulfida ini boleh digunakan untuk menghubungkan dua protein bersama-sama.

Tetapi, lebih kerap daripada tidak, jika anda melihat struktur protein tunggal, inilah struktur protein tunggal.

Dan selalunya, terdapat ikatan intramolekul, ikatan disulfida, iaitu, ikatan dari satu domain protein ke yang lain, dari satu bahagian protein ke yang lain.

Saya akan menarik mereka di sini.

Di sini mungkin ikatan disulfida.

Di sini mungkin ikatan disulfida, dan saya boleh meneruskan dan seterusnya.

Mungkin ada seorang lagi di sini.

Mengapa kita mempunyai ikatan disulfida ini? Kerana seperti yang akan kami nyatakan tidak lama lagi, struktur tiga dimensi protein ditentukan dengan sangat khusus.

Protein hanya boleh berfungsi apabila ia menganggap konfigurasi tiga dimensi tertentu, apabila ia menganggap konfigurasi stereokimia tiga dimensi tertentu.

Apabila kita bercakap tentang stereokimia, kita bercakap tentang struktur tiga dimensi molekul, kecil dan besar.

Dan, di sini, kita mula menyentuh tema bagaimana rantai polipeptida kompleks ini dapat mencipta protein yang mempunyai struktur yang sangat spesifik, selalunya sangat tegar, dalam ruang tiga dimensi.

Sebahagian daripada ketegaran struktur ini dikekalkan oleh ikatan disulfida kovalen ini, yang menghubungkan rapat kawasan jiran, atau bahkan kawasan yang tidak begitu jiran, bagi rantai polipeptida tunggal, pautan intramolekul ini.

Ini tidak menghalang wujudnya hubungan antara molekul antara dua rantai polipeptida yang dimediasi juga oleh ikatan disulfida.

Berikut adalah satu lagi asid amino yang sangat pelik kerana apa yang anda lihat di sini adalah pada rantai sisi, iaitu CH2, CH2, CH2, CH2 ialah hidrogen yang terikat di sini kepada kumpulan amina.

Ia tidak berayun di ruang kosong.

Apa yang kita lihat di sini ialah CH2, CH2 adalah terikat kovalen kepada kumpulan amina.

Awak ambil itu, kan? Saya hanya menguji awak.

OK, jadi di sini kita melihat cincin lima anggota yang dicipta.

Jadi di sini, perkara ini tidak berayun di ruang bebas.

Ia mencipta cincin lima anggota di mana hujung rantai sisi sebenarnya dikaitkan secara kovalen kepada kumpulan amino.

Dan, itu juga mempunyai implikasi untuk struktur protein kerana asid amino tertentu ini, apabila ia berlaku dalam rantai polipeptida, tidak mempunyai kefleksibelan untuk menganggap konfigurasi tertentu yang lain mempunyai empat rantai sampingan yang tidak begitu dibebani.

Tiada satu pun daripada mereka mempunyai fleksibiliti sepenuhnya, tetapi yang ini jauh lebih terbeban dalam jenis struktur tiga dimensi yang boleh diandaikan.

Dan, dengan mengambil kira itu, kami mula bertanya soalan tentang bagaimana rantai polipeptida menganggap struktur tiga dimensi.

Jika kita bercakap tentang rantai polipeptida, dalam fikiran kita, mudah-mudahan, terdapat hanya 28 kombinasi.

Oh, saya baik atau apa? Bagaimanapun, baiklah, jadi, lihat di sini.

Dan di sini, anda lihat, ini adalah rantai polipeptida biasa.

Di sini, kami mempunyai kod tiga huruf.

Sebenarnya, terdapat satu kod huruf yang diperkenalkan sekitar tahun 1965. Jadi, setiap 20 asid amino mempunyai kod huruf tunggalnya sendiri.

Dan, untuk membuat pengakuan terus terang dan menyedihkan, 35 tahun, 40 tahun selepas kod huruf asid amino tunggal dimulakan, saya masih belum mempelajarinya.

Tetapi, kita boleh mempelajari tiga kod huruf ini, yang bernasib baik ada di sini.

Dalam kod huruf tunggal L ialah lucine, dan A ialah alanin, lihat, mereka tahu itu.

Ini adalah satu lagi contoh tidak dapat mengajar anjing lama helah baru.

Bagaimanapun, di sini kita melihat caranya, satu cara yang boleh menggambarkan rantai asid amino, rantai polipeptida.

Dan perlu diingat, ini boleh berterusan selama-lamanya.

Apabila kita mula bergelut dengan struktur tiga dimensi rantai, kita mula menyedari perkara berikut, dan iaitu selepas rantai itu pada mulanya disintesis, ia pada mulanya huru-hara.

Dan, apabila ia meluas, ia semakin mula menganggap konfigurasi molekul tiga dimensi yang sangat spesifik yang ditunjukkan di sini.

Jadi, huru-hara yang beroperasi pada mulanya akhirnya akan menghasilkan konfigurasi asli di sini, yang dalam banyak aspek sering mewakili keadaan tenaga bebas yang paling rendah.

Sejak 40 tahun yang lalu, orang ramai telah cuba memikirkan, jika anda tahu urutan asid amino polipeptida utama ini di sini, jika anda tahu struktur utamanya, dan apabila saya katakan, ?struktur utama,? apa yang saya maksudkan ialah urutan asid amino.

Jadi, jika anda mengetahui struktur utama asid amino, anda sepatutnya, pada dasarnya, dapat membangunkan algoritma komputer yang akan meramalkan konfigurasi tiga dimensi, yang ditunjukkan di sini dengan cara yang sangat skematik, dan yang akan kita bincangkan. dengan lebih terperinci tidak lama lagi.

Dan, hakikatnya, selepas 40 tahun mencuba, seseorang masih tidak dapat melakukannya, iaitu, jika saya memberikan urutan asid amino primer polipeptida kepada ahli biokimia paling bijak di dunia, dan terdapat beberapa yang sangat pintar. , dia masih tidak dapat memberitahu saya apakah struktur tiga dimensi protein ini dengan pasti.

kenapa? Kerana terdapat bilangan interaksi intramolekul yang hampir tidak terhingga yang sangat merumitkan cara protein mengambil struktur.

Lebih-lebih lagi, jika kita bercakap tentang ini sebagai keadaan asal protein, kita boleh membayangkan bahawa ada cara untuk mengganggunya kerana kebanyakan keadaan asal ini dicipta oleh ikatan hidrogen intramolekul.

Ingat, ikatan hidrogen adalah agak lemah, dan jika kita memanaskan suhu, maka kita boleh memecahkan ikatan hidrogen.

Oleh itu, setiap kali kita menggoreng telur, sebagai contoh, jika kita ingin turun ke Bumi, kita denaturasi. Kami memecahkan struktur tiga dimensi asli molekul albumin yang membentuk putih telur.

Oleh itu, apabila semuanya menjadi putih, apa yang telah kita lakukan ialah mengambil molekul asli seperti ini, memanaskannya sehingga suhu di mana ikatan intramolekul tidak lagi stabil.

Terutama, ikatan hidrogen tidak lagi menstabilkan konfigurasi tiga dimensi ini, dan kami meletakkannya dalam keadaan denaturasi, yang mungkin berada di sini.

Oleh itu, pemerolehan konfigurasi asli ini, atau keadaan asal, asli yang mewakili keadaan semula jadi, juga boleh diterbalikkan dalam banyak molekul hanya dengan memanaskannya.

Terdapat pasti lagi molekul lain yang berbeza daripada putih telur daripada albumin dalam putih telur di mana jika anda menyejukkannya kembali, mereka akan secara spontan mengambil semula struktur asalnya.

Banyak protein, kebanyakannya, tidak akan berbuat demikian.

Baiklah, sekali lagi, mari kita kembali kepada isu pemerolehan struktur tiga dimensi yang kompleks ini.

Dan di sini, kita mula melihat bagaimana beberapa struktur ini diperoleh dan distabilkan melalui ikatan hidrogen intramolekul ini. Dan terdapat banyak peluang untuk ikatan hidrogen intramolekul ini kerana di sini kita melihat satu rantai polipeptida di sini, di sini kita melihat yang lain.

Dan, kita lihat bahawa kumpulan NH2 di sini, saya minta maaf, kumpulan nitrogen di sini dengan rantai sisi proton, dan kumpulan karbonil di sini dengan oksigen tidak dibebani.

Mereka, pada dasarnya, tersedia untuk membentuk ikatan hidrogen dengan rantai polipeptida di tempat lain.

Sekarang, rantai polipeptida yang lain ini sekali lagi mungkin daripada protein lain, daripada polipeptida lain.

Tetapi lebih kerap daripada tidak, kita sekali lagi berurusan dengan pautan silang intramolekul. Tetapi dalam kes ini, ikatan silang intramolekul bukanlah ikatan disulfida yang bersifat kovalen, dan keras dan stabil sebagai batu tanpa ketiadaan agen penurunan.

Di sini, kita bercakap tentang ikatan yang lebih lemah, ikatan hidrogen yang juga bertindak antara gelung protein yang berbeza dan berfungsi, sekali lagi, untuk menstabilkan struktur tiga dimensi, keadaan asal protein.

Dan, anda boleh melihat bagaimana peluang untuk membentuk berbilang ikatan hidrogen ini boleh mewujudkan tahap kestabilan yang sangat besar.

Dan, berikut adalah beberapa contoh apa yang kini kita panggil struktur sekunder protein.

Hanya sesaat yang lalu, atau beberapa minit yang lalu jujur, dan saya sentiasa jujur ​​dengan anda, kelas, struktur utama ialah jujukan asid amino.

Struktur sekunder mewakili konfigurasi seperti ini.

Berikut ialah helaian berlipat beta.

Dan, apa yang kita lihat di sini dalam heliks alfa ini ialah kita mempunyai struktur heliks di mana kumpulan amina di bawah ini, kumpulan NH, ikatan hidrogen dengan sisa iaitu, saya fikir, tiga setengah sisa di hulu, satu, dua, ada amina di bawah sana, jadi, dengan kumpulan karbonil yang merupakan tiga setengah sisa di hulunya.

Yang ini, sekali lagi, mencapai tiga setengah sisa di hulu.

Tidak semua ikatan hidrogen ditunjukkan di latar belakang.

Hanya yang di sebelah heliks kita ditunjukkan, di bahagian hadapan heliks.

Tetapi, anda boleh bayangkan bahawa ini boleh mengekalkan dirinya.

Dan, setiap karbonil ini mungkin dikaitkan dengan proton, kumpulan NH yang sama ada di atas atau di bawah residu tertentu itu.

Dan ini, seterusnya, boleh mencipta struktur heliks.

By the way, proline tidak sesuai.

Jika anda menambah prolin di sini, prolin dikenali dalam perdagangan sebagai pemutus heliks.

kenapa? Kerana ia tidak boleh memutar dirinya untuk membentuk heliks alfa.

Oleh itu, jika asid amino primer menentukan bahawa prolin akan dimasukkan di sini, sebagai contoh, maka heliks ini mungkin wujud di bawah dan di atas, tetapi ia tidak akan berterusan kerana kehadiran prolin sangat mengganggu pembentukan heliks alfa.

Ini bermakna, pada dasarnya, anda boleh membuat beberapa ramalan tentang struktur setempat polipeptida dengan mengetahui sama ada prolin hadir atau tidak, sebagai contoh.

Tetapi itu masih tidak memberi anda kuasa untuk meramalkan keseluruhan struktur tiga dimensi protein siap itu sendiri.

Sekarang, mari kita bersetuju bahawa ini adalah struktur sekunder protein, iaitu, pelbagai domain yang sering membentuk heliks alfa dalam segmen tertentu protein atau segmen tertentu protein akan membentuk kepingan berlipat beta.

Dan terdapat beberapa jenis struktur sekunder lain yang kurang biasa.

Dan di sini, kita berurusan dengan struktur tertiari.

Sekarang kita semakin menarik.

Atau, mungkin anda tidak menyukainya.

Tetapi sesetengah orang mengatakan ia sangat menarik kerana berikut adalah struktur tertier beberapa protein yang dipilih secara sewenang-wenangnya.

Di sini, struktur tertier protein tertentu ini, dan identitinya tidak diberikan dalam buku teks kami.

Dan, saya pasti jika kita menghabiskan dua atau tiga minggu, kita boleh mengetahui apa itu.

Tetapi bagaimanapun, inilah protein, struktur tiga dimensi protein yang terdiri daripada empat heliks alfa yang naik.

Satu lagi alpha helix, alpha helix, alpha helix, alpha helix, mereka digambarkan di sini, mujurlah, dalam empat warna berbeza.

Oleh itu, kita melihat bahawa apa yang kita bincangkan tentang struktur tertiari, kita bercakap tentang bagaimana heliks alfa dilupuskan antara satu sama lain.

Struktur utama jujukan asid amino tidak ditunjukkan di sini.

Struktur sekunder mewakili heliks alfa individu ini, dan struktur tertier mewakili cara heliks alfa ini disusun berbanding satu sama lain.

Berikut adalah protein yang berstruktur jauh berbeza.

Ia terbentuk daripada banyak helaian berlipat beta.

Kami melihatnya dalam angka terakhir, dalam overhed terakhir.

Anda melihatnya sebagai struktur tiga dimensi keseluruhan yang agak berbeza.

Ini boleh menjadi permulaan kepada heliks alfa di sini, walaupun itu agak samar-samar.

Dan di sini, kita melihat satu lagi perkara.

Dan itu, seperti yang kita katakan sebelum ini, struktur tertier yang bebas daripada heliks alfa dan kepingan berlipat beta ini boleh distabilkan oleh ikatan silang antara untaian kovalen yang dibentuk oleh sistin.

Dan pada akhirnya, jika kita meletakkan semua itu bersama-sama, maka kita mendapat kesedaran bahawa struktur tiga dimensi protein seperti yang ditentukan oleh seni x-ray -- Di sana kita pergi.

Saya sebenarnya mempunyai seorang sepupu yang saya tidak akan sebutkan anaknya disleksia sehinggakan apabila dia menaiki tangga dia tidak tahu sama ada hendak menjejakkan kakinya ke atas atau ke bawah.

OK, bagaimanapun, kerana saya menyelesaikannya dalam masa kurang daripada dua minit, baiklah, jadi di sini kita lihat ini adalah rupa struktur tiga dimensi protein.

Ini dipanggil model mengisi ruang kerana di sini, seseorang menarik masuk, seperti yang ditentukan oleh kristalografi sinar-x apakah, jika kita dapat melihat rupa protein, bagaimana rupa sebenarnya, di mana setiap atom termasuk bahagian ini rantai sebenarnya digambarkan.

Sebelum ini, apabila kami menggunakan penerangan yang jauh lebih skematik seperti di sini, kami hanya bercakap tentang struktur keseluruhan tulang belakang.

Kami tidak benar-benar menunjukkan di mana rantai sisi berada, dan ruang yang akan diisinya.

Dan, jika kita memberi mereka peluang, jika kita memasukkan semua atom lain, rantai sisi, dan kita mencipta model mengisi ruang di mana atom sebenar ditunjukkan, ini adalah rupa protein.

Dan hakikatnya ialah semua hampir protein mempunyai struktur yang sangat spesifik.

Ia tidak seolah-olah mereka boleh beralih dari satu struktur ke yang lain.

Sebaik sahaja mereka meninggalkan struktur asal biasa mereka, mereka akan kehilangan keupayaan mereka untuk melakukan pekerjaan biasa mereka.

Dan, overhed khusus ini membawa masuk satu lagi tema yang akan kita fokuskan lagi, iaitu, apakah yang protein lakukan dalam sel? Saya gembira saya bertanya soalan itu.

Salah satu perkara yang mereka lakukan ialah mereka bertindak sebagai pemangkin, iaitu, sebagai enzim.

Hakikatnya, seperti yang akan kita bincangkan kemudian, hampir semua tindak balas biokimia memerlukan pemangkin enzim untuk mendorongnya ke hadapan.

Maksudnya, jika terdapat tindak balas biokimia yang berlaku, hampir selalu ia tidak akan berlaku secara spontan dengan cara yang sama seperti ion hidroksil dan hidrogen akan bergabung secara spontan dalam air.

Hampir semua tindak balas biokimia memerlukan pengantaraan enzim yang merupakan pemangkin biologi untuk menggalakkan ini berlaku.

Dan, hampir semua pemangkin dalam sel kita adalah protein.

Jadi, jika anda mempunyai 4,326 tindak balas biokimia yang berbeza yang berlaku dalam sel, ini bermakna mungkin terdapat hampir sama banyak enzim yang berbeza, setiap satu daripadanya ditugaskan untuk mengantara satu atau satu lagi tindak balas biokimia yang berbeza tersebut.

Dan di sini, kita melihat fakta bahawa ini adalah enzim yang kebetulan dipanggil hexokinase.

Ingat bahawa akhiran -ase pada akhir menentukan bahawa ini sudah menjadi enzim dan bukannya karbohidrat.

Dan, ini melekat, sebenarnya, kumpulan fosfat pada glukosa.

Dan, apa yang berlaku ialah glukosa, yang merupakan substrat, yang bertindak oleh pemangkin, ditarik ke dalam tapak ini dalam protein yang sangat khusus untuk mengantara tindak balas enzim.

Hampir semua perniagaan enzim kompleks ini dijalankan di sini.

Dan entah bagaimana, banyak asid amino lain yang terletak pada jarak yang melakukan perkara lain seperti mengawal aktiviti enzim.

Tetapi penghujung perniagaan sebenar enzim terdapat dalam apa yang dipanggil celah pemangkin, tapak aktif enzim ini di mana substrat ditarik masuk dan dimanipulasi dan diubah secara kimia oleh tindakan enzim tertentu ini.

Sekarang, dengan mengatakan bahawa hampir semua pemangkin, tetapi tidak semua, adalah protein, saya juga bermaksud untuk mengatakan bahawa protein mempunyai fungsi utama kedua dalam badan.

Fungsi utama pertama ialah bertindak sebagai enzim dalam mangkin.

Fungsi utama kedua adalah untuk mencipta struktur biokimia, iaitu, struktur protein sitoskeleton yang berbeza seperti yang saya tunjukkan kepada anda dua kuliah yang lalu.

Oleh itu, kita akan berulang kali datang ke situasi di mana entiti struktur kompleks dalam sel terdiri daripada protein struktur yang berbeza.

Sekali lagi, ini hanyalah pendahuluan untuk membicarakan perkara ini dengan lebih terperinci, dua fungsi utama pemangkinan enzimatik ini di satu pihak, dan mencipta struktur di sisi lain. Jadi sekarang, kita sampai kepada empat tahap hierarki struktur protein.

Struktur utama ialah urutan asid amino.

Dan, jika kita memikirkan untuk kedua urutan asid amino ini, mari kita sedar bahawa mana-mana asid amino tunggal boleh mengikuti mana-mana asid amino lain.

Jadi, maksudnya ialah jika glisin adalah asid amino pertama, seperti yang berlaku di sini, serine hanyalah satu daripada 20 asid amino kedua yang mungkin berbeza.

Asid aspartik hanyalah satu daripada 20 asid amino ketiga yang berbeza sebagai sisa ketiga.

Kita sering memanggil residu yang berbeza ini: residu pertama, residu kedua, residu ketiga, residu keempat, dan keempat, dan seterusnya.

Dan, perlu diingat, jika kita berfikir tentang implikasi gabungan itu, sisa asid amino pertama boleh mempunyai 20 yang berbeza.

Yang kedua boleh mempunyai 20 identiti berbeza.

Yang ketiga boleh mempunyai 20 identiti yang berbeza.

Ini bermakna jika kita membuat tripeptida - tripeptida mempunyai tiga asid amino di dalamnya.

Ini bermakna kita boleh membuat 400 dipeptida, 400 dipeptida berbeza, dan kita boleh membuat 8,000 tripeptida berbeza.

Sekarang, jika anda bayangkan bahawa purata asid amino, purata protein dalam sel adalah, katakan, 150 sisa asid amino panjang, ini bermakna bahawa pada dasarnya, seseorang boleh membuat 20 hingga 150 urutan asid amino berbeza kuasa kerana ketiadaan ini mana-mana kekangan yang mana asid amino akan mengikuti asid amino yang lain. Dalam erti kata lain, jika polipeptida purata mempunyai banyak residu ini, ini ialah bilangan 150 protein panjang sisa asid amino yang berbeza yang boleh, pada dasarnya, disintesis.

Saya tidak mengatakan kesemuanya pernah disintesis sejak pembentukan kehidupan di planet ini.

Sesungguhnya, kerana beberapa rantai asid amino adalah 4, 5, 600, malah 2,000 sisa asid amino panjang, saya fikir yang menjejaskan distrofi otot adalah lebih daripada 2,000 asid amino.

Dystrophin. Adakah sesiapa tahu di sini? Ianya besar.

Bagaimanapun, bayangkan bilangan kemungkinan.

Jadi, secara kombinatorial, kehidupan boleh membuat hampir semua jenis asid amino yang diingini dengan menentukan urutan asid amino.

Sekarang, mari kita pergi dan lihat di sini semula.

Terdapat struktur sekunder.

Struktur tertier ialah cara heliks alfa yang berbeza di sini atau helaian berlipat beta dilupuskan secara tiga dimensi berkenaan antara satu sama lain.

Dan, struktur kuaternari mewakili bagaimana polipeptida yang berbeza dikaitkan satu dengan yang lain.

Jadi, sebagai contoh, hemoglobin adalah tetramer.

Hemoglobin tidak wujud sebagai protein monomerik.

Penyelesaiannya wujud sebagai tetramer.

Dan terdapat dua jenis rantai globin.

Terdapat jenis alfa dan jenis beta.

Dan, jika kita melihat dengan cara yang sangat kasar dan skematik pada cara tetramer hemoglobin disusun, terdapat dua rantai polipeptida alfa dan dua rantai polipeptida beta.

Mereka tidak terikat secara kovalen antara satu sama lain.

Mereka dikaitkan antara satu sama lain melalui ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik.

Dan, ini ialah konfigurasi asli sebenar globin kepada rantai alfa dan beta.

Ia tidak wujud sebagai asid amino tunggal dalam larutan.

Dan, sememangnya, kebanyakan, atau saya tidak sepatutnya mengatakan kebanyakannya, tetapi sangat banyak protein wujud dalam konfigurasi ini di mana struktur tertiari mewakili empat rantai asid amino yang berbeza.

Dan setiap satu daripada ini mempunyai terminal N dan C.

Setiap daripada ini berbeza secara kimia.

Keempat-empat ini mungkin boleh dipisahkan antara satu sama lain hanya dengan menaikkan suhu.

Dan, mereka bergaul seperti ini.

Dan, jika tiada perkaitan ini, jika anda baru sahaja mempunyai salah satu daripada alfa ini, atau salah satu daripada beta ini, ia tidak akan berfungsi dengan baik sama sekali.

Malah, ia mungkin tidak berfungsi sama sekali.

Satu perkara lain yang mungkin tersirat kepada anda, tetapi saya tidak mengatakannya, tetapi yang sangat penting untuk disedari ialah yang berikut: Mari bayangkan bahawa ini adalah struktur tiga dimensi protein, kerana ia mungkin.

Sekarang mari kita fikirkan tentang asid amino hidrofobik dan hidrofilik.

Asid amino hidrofobik tidak suka ada air.

Dan oleh itu, mereka, kita boleh bayangkan kes ini dengan betul, terselit di dalam celahan protein jauh dari permukaan.

Mereka tidak mempunyai sebarang sentuhan dengan air.

Sebaliknya, asid amino hidrofilik bercas tinggi sebenarnya menonjol di permukaan.

Dan ini mula menghasilkan satu lagi gambaran tentang bagaimana stereokimia tiga dimensi protein dikekalkan dan ditentukan kerana asid amino hidrofobik, melalui interaksi hidrofobik, menstabilkan teras dalaman protein yang terlindung dengan baik daripada pelarut berair.

Asid amino hidrofilik berada di luar.

Mereka suka berada dalam hubungan intim dengan air.

Jadi, kita kini telah membincangkan beberapa interaksi berbeza yang berbeza yang bertanggungjawab untuk mencipta stereokimia tiga dimensi protein.

Pertama sekali, terdapat ikatan disulfida, yang mewujudkan interaksi kovalen rantai-ke-rantai.

Ia adalah ikatan hidrogen di mana rantai yang berbeza boleh berinteraksi antara satu sama lain.

Dan terdapat interaksi hidrofobik dan hidrofilik ini.

Dan, terdapat beberapa interaksi van der Waals yang agak tidak penting, yang sememangnya tidak berbaloi untuk dibincangkan walaupun sesetengah orang sangat teruja dengannya.

Jadi, di sini kita mula melihat bahawa kita mempunyai polipeptida yang sangat menarik tidak seperti polipeptida yang membosankan yang akhirnya menjadi cara seseorang mesti menilai karbohidrat.

Sesetengah orang menganggap kimia karbohidrat sangat menarik.

Tetapi ia sebenarnya tidak begitu menarik kerana anda hanya mempunyai monomer yang sama dalam seratus, atau 500 regangan.

Di sini, protein adalah lebih menarik kerana kebolehubahan yang besar dalam jujukan asid amino ini, dan keupayaan akibatnya untuk mencipta semua jenis kereaktifan dan struktur kimia kerana 20 asid amino yang berbeza ini.

Jika kita membayangkan kehidupan di planet lain, dan kita membayangkan bahawa terdapat, katakan, molekul seperti asid amino yang merupakan sebahagian daripada kehidupan, mungkin kehidupan lain tidak akan mempunyai 20 asid amino yang sama seperti kita.

Ia hampir pasti akan menjadi asas air seperti kita.

Tetapi, ia juga bergantung pada ikatan hidrogen dan hidrofilik, dan interaksi hidrofobisiti untuk menentukan struktur tiga dimensi.

Dengan ketiadaan struktur tiga dimensi yang sangat spesifik ini, saya akan memberitahu anda bahawa enzim ini tidak dapat berfungsi.

Dan, jika anda mengambil enzim ini, jika ia adalah enzim biasa dan anda memanaskannya secara ringkas, walaupun selalunya melebihi suhu badan normal, ia mungkin denaturasi, iaitu, ia mungkin kehilangan struktur tiga dimensinya secara tidak dapat dipulihkan.

Dan, setelah ia dinyahatur, proses denaturasi ini, ia mungkin tidak dapat secara spontan menganggap semula konfigurasi tiga dimensi yang sedia ada dan oleh itu akan menjadi tidak aktif selama-lamanya.

Ini bermakna untuk mengatakan dengan sangat jelas bahawa walaupun asid amino yang mencipta tapak pemangkin aktif itu kekal di sana.

Pelupusan tiga dimensi mereka yang sangat spesifik adalah penting untuk tindakan berterusan enzim ini.

Dan, apabila pelupusan tiga dimensi mereka dialihkan melalui proses interaksi, maka, kita menghadapi masalah kerana enzim tidak lagi dapat melakukan tugas yang diberikan.

Kita akan pergi sekarang ke susunan kerumitan yang lebih tinggi dari satu segi.

Kita akan pergi ke royalti makromolekul, iaitu asid nukleik.

Sudah tentu, ahli kimia protein akan mengambil berat tentang tanggapan bahawa terdapat perkara yang lebih baik daripada protein.

Tetapi, hakikatnya, saya tidak boleh menunjukkan overhead itu kepada anda kerana ia dari buku teks lain yang merupakan hak cipta, dan kami sedang difilemkan.

Berapa ramai orang yang telah mengabadikan bahagian belakang kepala mereka pada video ini? Adakah anda menelefon ke rumah dan meminta sesiapa untuk mengenal pasti anda? Saya tidak tahu, tetapi tidak lama lagi setiap daripada kita mendapat perhatian selama 15 minit seumur hidup, bukan? Jadi, anda mempunyai masa 15 minit.

Berikut adalah beberapa asid nukleik.

Dan mari kita lihat asid nukleik ini dan cara ia digabungkan.

Perlu diingat untuk menjangka apa yang akan kami katakan pada masa akan datang, sekali lagi, kami ingin membuat agregat hujung ke hujung.

Kami mahu mempolimerkan molekul.

Dan dalam kes ini, kami mahu melakukannya sekali lagi melalui tindak balas dehidrasi.

Dan, lebih-lebih lagi, hanya untuk melihat blok binaan asid nukleik, kita mulakan semula dalam kes ini dengan dua pentosa.

Ingat bahawa mereka mempunyai karbon fuor: satu, dua, tiga, empat, adakah saya katakan empat? Anda tahu saya maksudkan lima.

Jadi, apabila saya menyebut empat mulai sekarang, maksud saya, atau, apabila saya menyebut empat, saya mungkin juga bermaksud empat.

OK, satu, dua, tiga, empat lima.

Dan mari kita lihat dua jenis asas molekul pentosa yang terdapat dalam asid nukleik kerana ia menentukan perbezaan penting antara DNA dan RNA.

Berikut ialah sejenis pentosa lama yang agak biasa dengan lima karbon.

Dan inilah sejenis pentosa yang tidak dikenali yang kami panggil deoksiribosa. kenapa? Kerana jika anda melihat dengan teliti, anda akan melihat bahawa kumpulan hidroksil di sini, yang sepatutnya terdapat dalam mana-mana pentosa yang menghormati diri sendiri hilang, dan digantikan hanya dengan kumpulan hidrogen, iaitu, ia kehilangan oksigennya, dari mana datangnya perkataan , ?deoksiribosa,? dan akhirnya dengan jelas perkataan, ?asid nukleik deoksiribosa.?

Dan salah satu sifat, salah satu kebaikan karbohidrat, seperti yang kita bincangkan kali lepas, adalah kumpulan hidroksil yang banyak ini, yang mewakili peluang untuk semua jenis tindak balas dehidrasi yang boleh membolehkan seseorang membina molekul yang lebih kompleks.

Dan di sini, kita melihat struktur, sebagai contoh, deoksiribonukleotida yang struktur terperincinya akan kita bahas pada masa akan datang.

Tetapi, mari kita lihat bagaimana kumpulan hidroksil ini telah digunakan.

Kumpulan hidroksil, dalam kes ini dalam DNA, dan dengan cara ini perhatikan bahawa struktur yang saya tunjukkan di sini, terdapat rantai sisi yang dilampirkan di sini, dan rantai sisi yang dipasang di sini.

Dan kedua-duanya tidak bergantung pada sama ada terdapat hidrogen atau hidroksil di sini atau tidak.

Dan lihat apa yang berlaku di sini.

Di sini, kita mempunyai hidroksil di sini yang mana satu bes telah dilekatkan secara kovalen, sekali lagi, melalui tindak balas dehidrasi.

Dan di sini, kita mempunyai situasi di mana sebenarnya tiga kumpulan fosfat telah dilekatkan pada kumpulan hidroksil ke arah ini.

Dan, ini mewakili blok binaan asas asid nukleik.

Sekarang, salah satu perkara yang akan menjadi sangat penting dan anda perlu menghafal, saya memberitahu anda, anda tidak perlu menghafal apa-apa.

Tetapi anda tidak mempercayai saya, bukan? Baik.

OK, salah satu perkara yang anda perlu hafal ialah sistem penomboran di sini.

Ini nombor satu, dua, tiga, empat, lima, atau terus terang, dan anda tahu saya sentiasa begitu, satu perdana, dua perdana, tiga perdana, empat perdana, lima perdana.

Dan sistem penomboran itu, ternyata, akan menjadi sangat penting untuk perbincangan kami seterusnya.

Perhatikan di sini bahawa, sebagai contoh, di sini pada dua kedudukan utama bahawa deoksiribosa ini kekurangan oksigen yang terdapat secara normal dalam RNA.

Dan, dengan semua ini dalam fikiran, kita akan menunggu dalam ketegangan yang hebat sehingga hari Rabu apabila kita benar-benar bercakap tentang bagaimana ini dieksploitasi untuk membuat polimer yang sangat kompleks.


David A. Drummond, PhD

Dr. Drummond ialah Profesor Madya Biokimia & Biologi Molekul dan Genetik Manusia. Kumpulannya mengkaji cara sel bertindak balas terhadap tekanan pada tahap molekul, memfokuskan pada pembentukan dan pembubaran himpunan besar protein dan RNA semasa dan selepas tekanan seperti kejutan haba. Makmal Drummond menggunakan pelbagai teknik, termasuk pengimejan in vivo, penyusunan semula in vitro dan biokimia mekanistik, proteomik kuantitatif dan analisis evolusi molekul. Oleh kerana banyak ciri proses pemasangan yang dicetuskan tekanan dikongsi merentasi eukariota, termasuk manusia, kumpulan itu menggunakan yis tunas, Saccharomyces cerevisiae, sebagai organisma model.

Universiti Harvard
Cambridge, MA
- Biologi sistem
2011

Institut Teknologi California
Pasadena, CA
Ph.D. - Pengiraan dan sistem saraf
2006

Universiti Princeton
Princeton, NJ
B.S.E. - Kejuruteraan mekanikal dan aeroangkasa
1995

Kitaran Harian Pemeluwapan Protein Boleh Balik dalam Cyanobacteria.
Pattanayak GK, Liao Y, Wallace EWJ, Budnik B, Drummond DA, Rust MJ. Kitaran Harian Pemeluwapan Protein Boleh Balik dalam Cyanobacteria. Rep. Sel. 2020 Ogos 18 32(7):108032.
PMID: 32814039

Pengasidan intrasel sementara mengawal tindak balas kejutan haba transkrip teras.
Triandafillou CG, CD Katanski, AR Makan Malam, Drummond DA. Pengasidan intrasel sementara mengawal tindak balas renjatan haba transkrip teras. Elife. 2020 08 07 9.
PMID: 32762843

Penderiaan selular mengikut pemisahan fasa: Menggunakan proses, bukan hanya produk.
Yoo H, Triandafillou C, Drummond DA. Penderiaan selular mengikut pemisahan fasa: Menggunakan proses, bukan hanya produk. J Biol Chem. 2019 05 03 294(18):7151-7159.
PMID: 30877200

Tindak Balas Kebuluran Nitrogen Escherichia coli Adalah Penting untuk Kewujudan Bersama dengan Rhodopseudomonas palustris.
McCully AL, Behringer MG, Gliessman JR, Pilipenko EV, Mazny JL, Lynch M, Drummond DA, McKinlay JB. Tindak Balas Kebuluran Nitrogen Escherichia coli Adalah Penting untuk Kewujudan Bersama dengan Rhodopseudomonas palustris. Appl Environ Microbiol. 2018 07 15 84(14).
PMID: 29728387

Pemisahan Fasa Dicetuskan Tekanan Merupakan Tindak Balas Adaptif, Ditala Secara Evolusi.
Riback JA, Katanski CD, Kear-Scott JL, Pilipenko EV, Rojek AE, Sosnick TR, Drummond DA. Pemisahan Fasa Dicetuskan Tekanan Merupakan Tindak Balas Adaptif, Ditala Secara Evolusi. sel. 2017 03 09 168(6):1028-1040.e19.
PMID: 28283059

Faktor Kejutan Haba 1: Daripada Ketua Bomba kepada Pakar Kawalan Orang Ramai.
Triandafillou CG, Drummond DA. Faktor Kejutan Haba 1: Daripada Ketua Bomba kepada Pakar Kawalan Orang Ramai. Sel Mol. 2016 07 07 63(1):1-2.
PMID: 27392142

Agregat Protein Endogen Boleh Balik, Khusus, Aktif Berhimpun semasa Tekanan Haba.
Wallace EW, Kear-Scott JL, Pilipenko EV, Schwartz MH, Laskowski PR, Rojek AE, Katanski CD, Riback JA, Dion MF, Franks AM, Airoldi EM, Pan T, Budnik BA, Drummond DA. Agregat Protein Endogen Boleh Balik, Khusus, Aktif Berhimpun semasa Tekanan Haba. sel. 2015 Sep 10 162(6):1286-98.
PMID: 26359986

mRNA yang mati Mengisahkan Kisah Kehidupannya.
Wallace EW, Drummond DA. MRNA yang sekarat Menceritakan Kisah Kehidupannya. sel. 2015 Jun 04 161(6):1246-8.
PMID: 26046434

Nephrocalcinosis dalam Pembentuk Batu Kalsium Yang Tidak Menghidapi Penyakit Sistemik.
Bhojani N, Paonessa JE, Hameed TA, Worcester EM, Evan AP, Coe FL, Borofsky MS, Lingeman JE. Nephrocalcinosis dalam Pembentuk Batu Kalsium Yang Tidak Menghidapi Penyakit Sistemik. J Urol. 2015 Nov 194(5):1308-12.
PMID: 25988516

Perakaunan untuk bunyi eksperimen mendedahkan bahawa tahap mRNA, yang dikuatkan oleh proses pasca transkrip, sebahagian besarnya menentukan tahap protein keadaan mantap dalam yis.
Csárdi G, Franks A, Choi DS, Airoldi EM, Drummond DA. Perakaunan untuk bunyi eksperimen mendedahkan bahawa tahap mRNA, yang dikuatkan oleh proses pasca transkrip, sebahagian besarnya menentukan tahap protein keadaan mantap dalam yis. Genet PLoS. 2015 Mei 11(5):e1005206.
PMID: 25950722

Pew Scholar dalam Sains Bioperubatan
Amanah Amal Pew
2012 - 2016

Felo Penyelidik Sloan
Yayasan Alfred P. Sloan
2012 - 2014


Pembantu Penyelidik – Biokimia Protein dan Biologi Sel

Transition Bio ialah syarikat bioteknologi peringkat awal yang inovatif dengan visi untuk menjadi peneraju dunia dalam penemuan, analisis dan modulasi kondensat biologi. Syarikat itu didorong oleh penemuan dan diagnostik ubat tanpa hipotesis, dan membangunkan platform teknologi kelas pertama untuk analisis kondensat dan pemeriksaan dadah.

Transition Bio sedang mencari Pembantu Penyelidik yang berbakat dan bermotivasi tinggi dalam Biokimia Protein dan Biologi Sel untuk menyertai pasukan kami di Cambridge, UK. Calon yang berjaya akan memiliki BSc/MSc/Ph.D. ijazah dan sekurang-kurangnya dua tahun pengalaman makmal secara langsung. Mereka akan memiliki pengetahuan yang menyeluruh dalam teknologi pengeluaran protein untuk ketiga-tiga sistem ekspresi protein yang biasa digunakan (bakteria, serangga dan mamalia). Pemohon mestilah mahir dalam biologi molekul asas dan teknik biologi sel, dan mesti mempunyai pengalaman dalam bekerja dengan platform kromatografi (cth., sistem penulenan AKTA) termasuk penggunaan pertalian, pertukaran ion, immunoaffinity, kromatografi pengecualian saiz. Pengetahuan bekerja dengan protein pemisah fasa adalah aset. Calon mesti mempunyai keupayaan untuk bekerja secara berkesan sebagai sebahagian daripada pasukan dan mempunyai potensi untuk dapat bekerja secara bebas selepas latihan.

Kunci tanggungjawab:

  • Menghasilkan protein daripada sistem ekspresi heterolog termasuk serangga (baculovirus), mamalia, yis, dan sel bakteria
  • Membersihkan protein menggunakan platform kromatografi terkini dan kaedah analisis lain untuk memastikan penghasilan protein calon berkualiti tinggi
  • Melaksanakan dan membangunkan protokol biologi sel untuk penulenan dan pengasingan organel tanpa membran
  • Laksanakan strategi pengklonan untuk penjanaan binaan dan menjalankan ujian untuk pencirian molekul, biofizikal dan struktur protein
  • Menganalisis keputusan, menyelesaikan masalah teknikal, dan melaksanakan penyelesaian membentangkan keputusan pada mesyuarat
  • Menjalankan projek penyelidikan dalam persekitaran pasukan, memajukan pengeluaran protein pembentuk kondensat dan pembangunan protokol biologi sel
  • Mengekalkan dan melaksanakan amalan makmal yang baik, termasuk sistem buku nota makmal yang tepat, dan ikuti garis panduan dan amalan keselamatan makmal
  • Bekerja dengan berkesan dengan pasukan merentas fungsi untuk menyumbang kepada visi, strategi dan taktik organisasi

Kelayakan Asas:

  • BSc/MA/Ph.D. dalam Biokimia/Sains Protein/Biologi Sel (atau bidang yang serupa) dan sebaik-baiknya pengalaman industri dalam biokimia protein, biologi molekul, biologi sel atau disiplin berkaitan
  • Pengetahuan kukuh tentang strategi ekspresi dan penulenan protein rekombinan menggunakan serangga (baculovirus), mamalia, yis dan sistem ekspresi bakteria
  • Pengalaman praktikal dalam penulenan protein (cth., pertalian, ion dan kromatografi pengecualian saiz) menggunakan kedua-dua instrumen FPLC / HPLC terkini serta pendekatan penulenan kelompok
  • Pengalaman dalam biologi molekul standard dan teknik biologi sel termasuk kultur sel, penulenan DNA, reka bentuk PCR dan primer, teknik pengklonan, pengasingan plasmid dan penjujukan DNA
  • Pengalaman dalam teknik pencirian protein standard termasuk elektroforesis gel, UV/VIS dan teknik analisis protein lain
  • Keupayaan untuk menyusun, menganalisis dan menyampaikan maklumat dengan cara yang ringkas, tepat dan profesional kemahiran komunikasi bertulis dan lisan yang kuat kemahiran pengurusan data yang cemerlang
  • Tahap integriti yang tinggi dan orientasi pasukan sikap motivasi yang boleh dilakukan
  • Keupayaan dan keinginan untuk bekerja dalam persekitaran yang pantas, dipacu penyelidikan, dan keusahawanan

Kelayakan Pilihan:

  • Pengalaman dalam reka bentuk, ekspresi dan penulenan sistem protein pemisah fasa
  • 2+ tahun pengalaman industri atau pasca doktoral dalam biokimia protein, biologi molekul atau disiplin yang berkaitan
  • Pengalaman terdahulu dalam penemuan protein terapeutik, biokimia dan penyelidikan biologi sel


Tonton video: INTRODUCTION OF BIOCHEMICAL SAINS TECH FACULTY II PENGANTAR BIOKIMIA II FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI (Disember 2022).