Maklumat

Apakah maksud fizikal unit Svedberg?

Apakah maksud fizikal unit Svedberg?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Pekali pemendapan, menggunakan emparan, dinyatakan menggunakan unit Svedberg (simbol S, kadangkala Sv). Wikipedia menyatakan bahawa $S = 10^{-13}$ sec tetapi saya juga melihat dalam buku yang sebenarnya $S = 10^{-13}$ sec/$ ext{rad}^2$. Manakah antara ini yang betul?

Saya tahu bahawa ribosom 50S mempunyai berat molekul yang lebih tinggi daripada ribosom 30S dan atas sebab itu 50S akan bergerak lebih laju (pada tabung uji yang diletakkan di dalam emparan) daripada 30S, tetapi jika menggantikan S sebanyak $10^{-13}$ sec , bagi saya ini sedikit tidak intuitif, kerana 50S adalah $ 50 cdot {10 ^ -13} $ sec (dan itu lebih besar daripada $ 30 cdot {10 ^ -13} $ sec), yang bermaksud memerlukan lebih banyak masa untuk melancong? Jelas tidak, jadi apa makna fizikal masa dalam keadaan ini?

Sebagai tindak balas kepada Alan Boyd:

"Dalam erti kata lain, pada 1x g zarah 1S akan bergerak pada $10^{-13} mcdot s^{-1}$"atau $10^{-12}$? Memang 5.5j adalah nilai yang munasabah tetapi saya masih tidak dapat memahami kepentingan nisbah antara halaju dan pecutan yang sepadan dengan unit Svedberg (dalam saat). Mungkin $ 50 cdot {10 ^ -13} $ saat adalah masa yang diperlukan oleh ribosom kita untuk mencapai halaju terminal dalam cecair? Itu akan masuk akal, sebagai contoh, jika saya menjatuhkan kertas A4 yang tidak dilipat ke tanah, masa yang diperlukan untuk mencapai halaju terminal akan lebih rendah daripada masa yang diambil oleh kertas berlipat A4 untuk mencapai halaju terminal tertentu, yang lebih tinggi. daripada halaju dari kertas A4 yang dilipat, kerana luasnya lebih besar (daya geseran yang bertindak padanya akan sangat tinggi) yang selaras dengan pemerhatian yang dibuat (pada objek sentrifugasi dengan luas permukaan yang lebih besar akan bergerak pada kecepatan terminal yang lebih perlahan ). Apa pendapat kamu ?


Wikipedia:

Pekali pemendapan ialah nisbah kelajuan bahan dalam emparan kepada pecutannya dalam unit yang setanding. Bahan dengan pekali pemendapan 26S (26×10−13 s) akan bergerak pada 26 mikrometer sesaat (26×10−6 m/s) di bawah pengaruh pecutan sejuta graviti (107 m/s2). Pecutan emparan diberikan sebagai rω2; di mana r adalah jarak radial dari paksi putaran dan ω adalah halaju sudut dalam radian sesaat.

Dengan kata lain, pada 1x g zarah 1S akan bergerak pada 10-13 Cik-1 = 0.1 petang s-1

Zarah-zarah yang mempunyai nilai S yang lebih tinggi akan bergerak secara berkadar lebih cepat, dan daya g yang meningkat juga akan meningkatkan kadar pemendapan.

Mari kita lihat contoh ribosom 50S pada 100 000 g:

kadar pemendapan = 10-13 x 105 x 50 m sesaat = 50 x 10-8 Cik-1

Jadi berapa lama perjalanan 10 cm = 10-2 m?

=10-2/ (50 x 1010-8) s

= kira-kira 5.5 jam, yang kelihatan kira-kira betul.


Makromolekul

Bab 05- Makromolekul
Ringkasan Bab 5 Edisi Ke-9 Campbell Biology
Bab 5 Campbell, Reece 8e
Bab 5- Struktur dan Fungsi Makromolekul
Biologi AP Makromolekul .

Makromolekul
Sepanjang halaman Metabolisme: Dari Makanan kepada Bahan Api, tiga perkara utama makromolekul daripada makanan (dan produk pecahannya) dikodkan warna mengikut jenis. Karbohidrat berwarna merah, protein berwarna hijau, dan lemak berwarna kuning.

makromolekul Molekul besar terdiri daripada banyak molekul organik kecil yang sering dirujuk sebagai monomer cth, karbohidrat, lipid, protein, dan asid nukleik. Makromolekul adalah polimer monomer.

:
Karbohidrat, Lipid, Asid Nukleik dan Protein .

dan Prinsip Biologi Utama
Mollie Hilton TAQ1: 1) Urutan khusus ini telah terbentuk daripada untaian DNA oleh peringkat pertama sintesis protein, transkripsi. Polimerase RNA masuk.
Vampire Sotong Dari Neraka .

dan molekul lain yang lebih kecil. Empat kumpulan makromolekul ialah asid nukleik, protein, karbohidrat dan lipid. Asid nukleik (khususnya asid deoksiribonukleik, atau DNA) menyimpan data genetik sebagai urutan nukleotida.

dipanggil polimer kerana .
A. mereka diperbuat daripada banyak komponen.
B. mereka mengamalkan poliamori.
C. . mereka melekat pada poliuretana.
D. . mereka diperbuat daripada banyak vitamin.

antara nukleus dan sitoplasma berlaku melalui kompleks liang nuklear (NPC). NPC ialah struktur protein besar yang membentuk saluran akueus merentasi sampul atau membran nuklear.

seperti kanji, selulosa atau protein tidak dapat diserap dengan cepat oleh sel dan mesti dipecah menjadi unit yang lebih kecil sebelum dapat digunakan dalam metabolisme sel. Beberapa kelas biasa enzim mencerna polimer ini.

terdiri daripada penyatuan beberapa molekul serupa yang lebih kecil, yang kemudiannya dipanggil monomer. Biopolimer ialah polimer yang terdapat dalam organisma hidup. Selulosa, kanji, dan glikogen, sebagai contoh, adalah polimer glukosa.

Molekul kompleks yang besar, seperti asid nukleik, protein, karbohidrat, dan lipid, dengan berat molekul yang agak besar.
Tambahan.

Molekul besar yang diperlukan untuk kehidupan yang dibina daripada molekul organik yang lebih kecil dipanggil biologi

terdiri daripada karbon, hidrogen dan oksigen. Ahli biologi berminat dengan karbohidrat kerana ia berfungsi sebagai simpanan tenaga dan sebagai rangka kerja struktur dalam sel.

yang boleh mempunyai gabungan sifat yang luar biasa (cth., kuat dan lembut tetapi ringan). Bahan-bahan ini terdiri daripada subset biomaterial.

(biologi, biokimia) Cabang biologi yang mengkaji

kehidupan, seperti protein, lipoprotein dan asid nukleik. (wiktionary.com) 2. (Genetik) Cabang biologi yang mengkaji manipulasi urutan genetik DNA. (wiktionary.com) 3. (Genetik) Teknologi manipulasi gen.

Molekul Berukuran Tengah: Vitamin dan Subunit dari

Beberapa jenis yang berbeza

boleh dicerna oleh lisosom dan tiba di organel melalui laluan yang berbeza. Seperti yang digambarkan dalam Rajah 1, sebagai contoh, banyak organisma unisel dan sel tertentu dalam organisma multisel menggunakan zarah makanan dan barang lain melalui proses yang dipanggil fagositosis.

Jadi ia perlu memasang sejumlah besar

di tempat itu. Dan kemudian ia harus siap, dan kemudian harus menunggu kalsium masuk, dan kemudian dapat menyatu.

Dadah memberikan kesannya dengan mengganggu mana-mana daripada empat jenis

dalam tubuh manusia, iaitu protein, polisakarida, lipid dan asid nukleik.

Satu teknik untuk pemisahan

daripada molekul yang lebih kecil dengan meletakkannya di dalam membran separa telap, seperti Cellophane, memisahkannya daripada sejumlah besar air.

Digunakan untuk membuat gel poliakrilamida untuk pengasingan

secara elektroforesis. Gel poliakrilamida dihasilkan melalui pempolimeran akrilamida menjadi rantai linear dan memaut silang rantai akrilamida dengan bis-akrilamida (N,N'-methylene-bis-acrylamide).

(Biokimia) Sebatian yang mengganggu struktur air atau

untuk menggalakkan aktiviti yang biasanya dihalang oleh struktur.

Protein adalah salah satu molekul organik yang paling banyak terdapat dalam sistem hidup dan mempunyai pelbagai fungsi yang paling pelbagai

. Kesemuanya adalah polimer asid amino.

terdapat dalam semua sel dan virus. Fungsi asid nukleik mempunyai kaitan dengan penyimpanan dan ekspresi maklumat genetik. Asid deoksiribonukleik (DNA) mengekod maklumat yang diperlukan oleh sel untuk membuat protein.

Masalah 7: Daya lemah yang terlibat dalam interaksi antara

, seperti protein, boleh saling melekat erat dan khusus. Bagaimanakah daya lemah seperti tarikan elektrostatik, ikatan van der Waals, ikatan hidrogen, dan daya hidrofobik boleh membawa kepada lekatan yang begitu kuat?
A.

(cth. kanji, protein, trigliserida)
Karbohidrat
Molekul organik di mana C, H dan O terikat bersama dalam nisbah Cx(H2O)y
Berkhidmat sebagai sumber tenaga yang penting untuk pernafasan otak dan selular
Tumbuhan menghasilkan karbohidrat dengan menggunakan tenaga daripada cahaya matahari .

Model quasispesies berguna dalam memberikan pemahaman kualitatif mengenai proses evolusi replikasi diri

seperti RNA atau DNA atau organisma aseksual ringkas seperti bakteria atau virus (quasisspesies virus), dan membantu dalam menerangkan sesuatu tentang peringkat awal asal usul kehidupan.

Sebilangan daripada beberapa teknik untuk memisahkan

berdasarkan penghijrahan mereka dalam gel atau medium lain yang tertakluk kepada medan elektrik yang kuat. (Rajah 3-41)
elektroforegram
Autoradiogram gel di mana molekul telah dipisahkan oleh elektroforesis gel. (Rajah 7-23b) .

oleh peleburan vesikel dengan membran plasma.
exon
Kawasan pengekodan gen eukariotik yang dinyatakan. Ekson dipisahkan antara satu sama lain oleh intron.

Lisosom - kantung membran enzim yang boleh mencerna sel

.
Meiosis - proses pembahagian sel dua bahagian dalam organisma yang membiak secara seksual. Meiosis menghasilkan gamet dengan separuh bilangan kromosom sel induk.

Unit Svedberg (70s) - Satu unit bersamaan dengan 10-13 saat digunakan untuk menyatakan pemendapan
pekali bagi

. Simbol S. Dinamakan untuk Theodor Svedberg,
Ahli kimia Sweden, 1884-1971, penemu ultrasentrifuge dan pemenang
Hadiah Nobel untuk kimia pada tahun 1926 untuk kerjanya mengenai sistem penyebaran.

biologi molekul Kajian tentang pembentukan, struktur, dan fungsi

terdapat dalam organisma hidup, terutamanya asid nukleik dan protein.
pertanian molekul Perkembangan haiwan transgenik untuk menghasilkan protein manusia.

Makanan yang berbeza terdiri terutamanya daripada salah satu daripada tiga berikut

: karbohidrat (roti dan pasta), lipid (lemak dan minyak), atau protein (daging dan kacang). Semasa pencernaan makanan, apabila makanan pertama kali dipecahkan secara dalaman, molekul besar ini dipecahkan kepada subunit.

(en-doh-sy-toh-sis) [Gk. endon, dalam + kytos, kapal]
Pengambilan selular daripada

dan bahan zarah mengikut kawasan setempat membran plasma yang mengelilingi bahan dan mencubit untuk membentuk vesikel intrasel.
endoderm .

Ikatan Intramolekul dan Pengenalpastian Organik dan Bukan Organik

Pengenalan Molekul Organik I: Kumpulan Berfungsi
Asid dan Bes .

Fagositosis mekanisme di mana sel-sel memakan zat-zat besar ekstraselular, termasuk

, bahagian atau keseluruhan sel dan mikroorganisma lain
Fagosom vakuol sitosolik yang mengandungi bahan yang ditangkap oleh fagositosis, dan yang ditakdirkan untuk dimusnahkan.

Lisosom: Mengandungi banyak enzim pencernaan untuk menghidrolisis

seperti protein dan lipid ke dalam monomernya.

permukaan pengecaman Struktur tiga dimensi permukaan membran biologi yang memberikan kekhususan disebabkan oleh

dari pelbagai ukuran dan bentuk yang memanjang di atas lapisan dua lipid.

Makna kedua merujuk kepada pengklonan DNA, atau tindakan mencipta salinan gen individu, untuk ekspresi dalam perumah asing, yang membawa kepada penjanaan replika tepat

- Molekul besar dan kompleks, seperti protein, asid nukleik, lipid dan karbohidrat, yang dihasilkan hanya oleh organisma hidup. Molekul biologi sering dirujuk sebagai

nukleoplasma. Kandungan sangat likat yang, dalam nukleus sel, sepadan dengan sitoplasma kawasan selular di luar nukleus. Ia adalah medium di mana yang hebat

- terutamanya kromosom - tinggal.

Semasa hidup, ia adalah bahan kimia sehingga turun. (Kami belum mengesahkan sejauh mana penyu pergi, tetapi ia agak jauh.) Dalam unit ini, kami akan terus ke bahagian bawah piramid biologi dengan mempelajari beberapa konsep asas, termasuk ikatan atom, sifat air, dan

autotrof: Organisma yang memerangkap tenaga daripada sumber fizikal atau kimia dan menggunakan tenaga untuk memasang

yang mana mereka dibuat. Fotosintesis adalah satu-satunya proses yang mana ini berlaku dalam eukariota, tetapi proses tambahan ditemui di kalangan organisma prokariot. Bandingkan dengan heterotrofik.

penting dalam pewarisan biologi. (ORNL)
perubatan molekul
Rawatan kecederaan atau penyakit pada tahap molekul. Contohnya termasuk penggunaan ujian diagnostik berasaskan DNA atau ubat yang diperoleh daripada maklumat jujukan DNA. (ORNL)
Gangguan monogenik.


Struktur dan Komposisi Ribosom

Ribosom terdiri daripada RNA ribosom (rRNA) dan protein. Sel prokariotik mempunyai tiga jenis rRNA: 16S rRNA, 23S rRNA, dan 5S rRNA. Seperti pemindahan RNA (tRNA), rRNA menggunakan ikatan H intrastrand antara asas nukleotida pelengkap untuk membentuk struktur terlipat yang kompleks. Ribosom terdiri daripada dua subunit dengan ketumpatan 50S dan 30S (& quotS & quot merujuk kepada satuan ketumpatan yang disebut unit Svedberg). Subunit 30S mengandungi 16S rRNA dan 21 protein subunit 50S mengandungi 5S dan 23S rRNA dan 31 protein. Kedua-dua subunit bergabung semasa sintesis protein untuk membentuk ribosom 70S lengkap kira-kira 25nm diameter. Bakteria biasa mungkin mempunyai sebanyak 15,000 ribosom.

Ketumpatan Subunit Ribosom

Ribosom terdiri daripada dua subunit yang bersatu untuk menterjemahkan RNA messenger (mRNA) kepada polipeptida dan protein semasa terjemahan dan biasanya diterangkan dari segi ketumpatannya. Ketumpatan ialah jisim molekul atau zarah dibahagikan dengan isipadunya dan diukur dalam unit Svedberg (S), unit ketumpatan sepadan dengan kadar relatif pemendapan semasa sentrifugasi berkelajuan ultra tinggi. Semakin besar nilai S, semakin padat zarahnya.

Subunit ribosom terdiri daripada RNA ribosom (rRNA) dan protein. Subunit ribosom dengan nilai S yang berbeza terdiri daripada molekul rRNA yang berlainan, serta protein yang berbeza. Ingat bahawa RNA ialah polimer ribonukleotida yang mengandungi asas nitrogenous adenine, uracil, guanin, atau sitosin. Molekul rRNA yang berbeza mempunyai panjang yang berbeza dan mempunyai susunan asas ribonukleotida yang berbeza. Oleh kerana rRNA adalah untai tunggal, banyak asas nukleotida rRNA terlibat dalam ikatan hidrogen intrastrand dan inilah yang memberikan molekul rRNA bentuk khususnya (lihat Rajah (PageIndex<1>)). Bentuk, seterusnya, membantu menentukan fungsinya - sama seperti interaksi antara asid amino dalam protein menentukan bentuk dan fungsi protein itu (lihat Rajah (PageIndex<2>)).

Ilustrasi rRNA 16S dalam Escherichia coli

Ilustrasi enzim katalase

Ribosom prokariotik, sebagai contoh, terdiri daripada dua subunit dengan ketumpatan 50S dan 30S. Subunit 30S mengandungi panjang 16S rRNA 1540 nukleotida dan 21 protein subunit 50S mengandungi panjang nukleotida 5S rRNA 120, panjang nukleotida 23S rRNA 2900, dan 31 protein. Kedua-dua subunit bergabung semasa sintesis protein untuk membentuk ribosom 70S yang lengkap.

Subunit ribosom eukariotik mempunyai ketumpatan 60S dan 40S kerana ia mengandungi molekul rRNA dan protein yang berbeza daripada subunit ribosom prokariotik. Dalam kebanyakan eukariota, subunit 40S mengandungi 18S rRNA 1900 nukleotida panjang dan kira-kira 33 protein subunit 60S mengandungi 5S rRNA 120 nukleotida panjang, 5.8S rRNA 160 nukleotida panjang, 28S rRNA 4700 nukleotida long490 dan nukleotida protein. Kedua-dua subunit bergabung semasa sintesis protein untuk membentuk ribosom 80S lengkap kira-kira 25nm diameter.

Disebabkan oleh perbezaan dalam rRNA dan protein tertentu ini, terhasillah "shape,", terdapat ubat yang boleh mengikat sama ada pada subunit ribosom 30S atau 50S ribosom prokariotik dan seterusnya menyekat fungsinya tetapi tidak dapat mengikat subunit 40S atau 60S yang setara dengannya. ribosom eukariotik.


Prinsip Asas Pemendapan dan Pekali Pemendapan | Sentrifugasi

Kadar pemendapan adalah bergantung kepada medan emparan yang digunakan (G) yang diarahkan dengan mudah ke luar ini ditentukan oleh kuasa dua halaju sudut pemutar (ω dalam radian s -1 ) dan radian (r, dalam sentimeter) bagi zarah dari paksi putaran, mengikut persamaan

Oleh kerana satu pusingan pemutar adalah bersamaan dengan 2 radian, halaju sudutnya, dalam radian s -1, boleh dinyatakan dengan mudah dalam sebutan pusingan seminit (putaran min -1), cara biasa untuk menyatakan kelajuan pemutar ialah

Medan emparan (G) dari segi rev min -1 adalah kemudian

G = 4π2 (pulangan min -1 ) 2 r/3600

dan secara amnya dinyatakan sebagai gandaan medan graviti bumi (g = 981 cm s -1), iaitu, nisbah berat zarah di medan sentrifugal dengan berat zarah yang sama apabila bertindak oleh graviti sahaja, dan kemudiannya dirujuk sebagai medan emparan relatif (RCF) atau lebih biasa sebagai 'bilangan kali g'.

RCF = 4π 2 (rev min -1) 2 r / 3600 × 981,

yang boleh dipendekkan untuk memberi

RCF = (1.118 × 10 -5 ) (pulangan min -1 ) 2 r.

Oleh kerana rotor berbeza daripada pelbagai pembuatan, kami menggunakan RCF untuk mewakili daya sentrifugasi.

Apabila keadaan untuk pemisahan emparan zarah dilaporkan, oleh itu, kelajuan pemutar, dimensi jejari dan masa operasi pemutar mesti semuanya disebut. Oleh kerana eksperimen biokimia biasanya dijalankan dengan zarah terlarut atau terampai dalam larutan, kadar pemendapan zarah adalah bergantung bukan sahaja pada medan emparan yang digunakan tetapi juga pada jisim zarah, yang boleh dinyatakan sebagai hasil darab isipadunya dan ketumpatan, ketumpatan dan kelikatan medium di mana ia mendapan dan sejauh mana bentuknya menyimpang dari sfera.

Apabila mendapan zarah ia mesti menyesarkan sebahagian daripada larutan di mana ia terampai, menghasilkan daya tujahan ke atas yang jelas sama dengan berat cecair yang disesarkan. Sekiranya zarah dianggap bulat dan mempunyai isipadu dan ketumpatan yang diketahui, yang terakhir diperbaiki untuk daya apung kerana ketumpatan medium, maka daya keluar bersih (F) yang dialaminya ketika disentrifugasi pada kecepatan sudut ω radian s -1 diberikan oleh

di mana 4/3πr 3 hlm ialah isipadu sfera berjejari rhlm, hlmhlm ialah ketumpatan zarah, pm ialah ketumpatan medium penggantungan, dan r adalah jarak zarah dari pusat putaran. Zarah, bagaimanapun, menjana geseran semasa ia berhijrah melalui larutan. Sekiranya zarah kaku dan sfera dan bergerak pada halaju yang diketahui, maka daya geseran (F0) usul menentang diberikan oleh

di mana v ialah halaju atau kadar pemendapan zarah, dan f ialah pekali geseran zarah dalam pelarut. Pekali geseran zarah ialah fungsi saiz, bentuk dan penghidratannya, dan kelikatan medium, dan menurut persamaan Stokes, untuk zarah sfera yang tidak terhidrat, diberikan oleh

di mana η ialah pekali kelikatan medium.

Untuk zarah tidak simetri dan/atau terhidrat, jejari sebenar zarah dalam digantikan dengan jejari Stokes berkesan, reff. Partikel sfera yang tidak terhidrat dengan isipadu dan ketumpatan yang diketahui, dan terdapat dalam medium ketumpatan malar, oleh itu mempercepat di medan sentrifugal, halaju meningkat sehingga daya jaring pemendapan sama dengan daya geseran yang menolak pergerakannya melalui medium, iaitu ,

Dalam praktiknya, pengimbangan daya ini berlaku dengan cepat dan zarah mencapai halaju tetap kerana rintangan geseran meningkat dengan halaju zarah. Di bawah keadaan ini, daya bersih yang bertindak ke atas zarah adalah sifar. Oleh itu, zarah tidak lagi memecut tetapi mencapai halaju maksimum, dengan keputusan bahawa ia kini mendapan pada kadar yang tetap. Kadar pemendapannya (v) kemudiannya diberikan oleh

Jelas daripada persamaan ini bahawa kadar pemendapan zarah tertentu adalah berkadar dengan saiznya, dengan perbezaan ketumpatan antara zarah dan medium dan dengan medan emparan yang digunakan. Ia adalah sifar apabila ketumpatan zarah dan medium adalah sama ia berkurangan apabila kelikatan medium bertambah, dan meningkat apabila medan daya bertambah. Namun, kerana persamaan melibatkan kuadrat dari jari-jari partikel, jelas bahawa ukuran zarah mempunyai pengaruh terbesar terhadap kadar pemendapannya.

Pekali Pemendapan (S):

di mana S = halaju terminal / pecutan unit

Pekali pemendapan mempunyai unit sek. 10 -13 saat dipanggil 1 Svedberg (atau 1 S).

f = pekali geseran zarah dalam pelarut

Watak Sedimen Pekali (S):

1. S dinaikkan untuk zarah dengan jisim yang lebih besar (kerana daya sedimen pada α man (1 & # 8211 vr)).

2. S ditambah untuk zarah yang mempunyai ketumpatan lebih besar (isipadu sama).

3. S dinaikkan untuk struktur yang lebih padat (bentuk) dengan jisim zarah yang sama (pekali geseran kurang).


Apakah maksud fizikal unit Svedberg? - Biologi

Semasa kuiz kumpulan kami hari ini di The Cell, salah satu soalan adalah berkaitan dengan saiz Ribosom dalam sel Prokariotik dan Eukariotik. Rakan-rakan saya dan saya bergurau sambil berkata dengan kuat "40S..40S..Ya lelaki itu." Jelas sekali ia bukan salah satu pilihan tetapi kami berseronok! Dan dengan keseronokan saya bermaksud cuba untuk tidak memberikan jawapan kepada sesiapa yang tidak tahu! Kumpulan kecil kami tahu bahawa ukuran Ribosom untuk sel Prokariotik sedikit lebih kecil daripada sel Eukariotik 70S dan 80S dengan hormat. Ini membuatkan saya terfikir, saya tahu bahawa Unit "S" bukan SI mewakili unit Svedberg tetapi apakah yang sebenarnya mewakilinya dan apakah maksudnya kepada saya sebagai pelajar Biokimia? Sepanjang hari dan seterusnya membuat saya berfikir bahawa dalam semua perbandingan antara sel Prokariotik dan Eukariotik bahawa "S" menonjol seperti SUCKER!

Ribosom ialah struktur molekul kompleks yang berfungsi sebagai tapak untuk Sintesis Protein.

“S” mewakili unit Svedberg , unit bukan SI untuk kadar pemendapan . Ini ialah kadar di mana zarah-zarah saiz tertentu dan bentuk tertentu bergerak ke bahagian bawah tiub di bawah daya emparan. Ini mencerminkan kadar di mana sedimen molekul di bawah daya emparan emparan, di mana sedimen merujuk kepada pecahan ke dalam zarah yang lebih kecil.

Apakah maksud ini kepada saya sebagai pelajar Biokimia?

Ini hanya mewakili ukuran subunit yang membuat struktur Ribosom. Memetik dari Nobelprize.org

"Oleh kerana zarah-zarah ribosom pertama kali diasingkan dari lisat sel dengan ultrasentrifugasi, ribosom dan sub-partikel mereka diberi nama sesuai dengan ciri pemendapan mereka semasa sentrifugasi. Sifat pemendapan zarah bergantung kepada saiz molekul dan bentuk geometrinya. Ciri-ciri pemendapan juga bergantung pada sifat fizikal larutan yang melaluinya zarah itu mendapan.”

Kedua-dua subunit ribosom eukariotik mempunyai pekali pemendapan 40 x 10 -13 dan 60 x 10 -13 . Oleh kerana satu unit Svedberg (S) ialah 10 -13 , dua subunit ribosom dirujuk sebagai subunit ribosom 40S dan 60S.

Jisim molekul zarah 40S dan 60S ialah 1.5 dan 3.0 juta g/mol, masing-masing. Oleh itu, ribosom lengkap mempunyai jisim kira-kira 4.5 juta g / mol. Ribosom lengkap dirujuk sebagai ribosom 80S."

Jadi sekarang saya faham apa itu unit Svedberg dan saya tahu lelaki yang menemuinya …… ​​.. ahli kimia Sweden Theodor Svedberg (1884–1971 ).


Ultrasentrifugasi Analitik

Catherine T. Chaton , Andrew B. Herr , dalam Kaedah dalam Enzimologi , 2015

Abstrak

Ultrasentrifugasi analisis halaju pemendapan (SV-AUC) telah menyaksikan kebangkitan semula dalam populariti sebagai teknik untuk mencirikan makromolekul dan kompleks dalam larutan. SV-AUC ialah alat yang sangat berkuasa untuk mengkaji konformasi protein, stoikiometri kompleks dan sistem berinteraksi secara umum. Menolak data halaju untuk menentukan taburan pekali pemendapan c(s) membolehkan kajian sama ada protein individu atau campuran berbilang komponen. Piawaian c(s) pendekatan mengira jisim molar spesies pemendam berdasarkan penentuan nisbah geseran (f/f0) daripada bentuk sempadan. Nisbah geseran dalam kes ini ialah parameter purata berat, yang boleh membawa kepada herotan anggaran jisim dan kehilangan maklumat apabila cuba menganalisis campuran makromolekul dengan bentuk yang berbeza. Sambungan dua dimensi bagi c(s) pendekatan analisis menyediakan taburan saiz dan bentuk yang menerangkan data dari segi pekali pemendapan dan grid nisbah geseran. Ini membolehkan peleraian spesies yang lebih baik dengan bentuk yang sangat berbeza yang mungkin mendapan bersama dan memberikan penentuan jisim molar yang lebih baik untuk campuran berbilang komponen. Contoh contoh digambarkan menggunakan protein globular dan nonglobular dengan jisim yang berbeza dengan pekali pemendapan hampir sama yang hanya dapat diselesaikan dengan menggunakan taburan ukuran dan bentuk. Aplikasi lain pendekatan analitikal ini untuk sistem biologi kompleks dibentangkan, memfokuskan pada protein yang terlibat dalam tindak balas imun semula jadi kepada DNA mikrob sitosolik.


Rangkuman

Sebagai organisma bersel tunggal yang hidup dalam persekitaran yang tidak stabil, sesetengah sel prokariotik mempunyai keupayaan untuk menyimpan lebihan nutrien dalam struktur sitoplasma yang dipanggil kemasukan. Menyimpan nutrien dalam bentuk terpolimer adalah berfaedah kerana ia mengurangkan pembentukan tekanan osmotik yang berlaku semasa sel mengumpul zat terlarut. Pelbagai jenis rangkuman menyimpan glikogen dan kanji, yang mengandungi karbon yang boleh diakses oleh sel untuk mendapatkan tenaga. Granul volutin, juga dipanggil granul metachromatic kerana ciri pewarnaannya, adalah kemasukan yang menyimpan fosfat tak organik terpolimer yang boleh digunakan dalam metabolisme dan membantu dalam pembentukan biofilm. Mikrob yang diketahui mengandungi butiran volutin termasuk archaea Methanosarcina, bakteria Corynebacterium diphtheriae, dan alga eukariotik unisel Chlamydomonas. Butiran sulfur, satu lagi jenis kemasukan, terdapat dalam bakteria sulfur genus Thiobacillus butiran ini menyimpan unsur sulfur, yang digunakan oleh bakteria untuk metabolisme.

Kadang-kadang, jenis kemasukan tertentu dikelilingi oleh monolayer fosfolipid yang disertakan dengan protein. Polyhydroxybutyrate (PHB), yang boleh dihasilkan oleh spesies Bacillus dan Pseudomonas, ialah contoh kemasukan yang memaparkan jenis struktur monolayer ini. Dari segi perindustrian, PHB juga telah digunakan sebagai sumber polimer terbiodegradasi untuk bioplastik. Beberapa jenis kemasukan yang berbeza ditunjukkan dalam Rajah (PageIndex<8>).

Rajah (PageIndex<8>): Sel prokariotik mungkin mempunyai pelbagai jenis kemasukan. (a) Mikrograf elektron penghantaran titisan lipid polyhydroxybutryrate. (b) Mikrograf cahaya butiran volutin. (c) Mikrograf kontras fasa bagi butiran sulfur. (d) Mikrograf elektron transmisi magnetosom. (e) Mikrograf elektron penghantaran vakuol gas. (kredit b, c, d: pengubahsuaian kerja oleh American Society for Microbiology)

Sesetengah sel prokariotik mempunyai jenis kemasukan lain yang berfungsi selain daripada penyimpanan nutrien. Sebagai contoh, beberapa sel prokariotik menghasilkan vakuol gas, pengumpulan vesikel gas kecil yang dibarisi protein. Vakuol gas ini membenarkan sel prokariotik yang mensintesisnya mengubah daya apungannya supaya mereka boleh menyesuaikan lokasinya dalam lajur air. Bakteria magnetik, seperti Magnetospirillum magnetotacticum, mengandung magnetosom, yang merangkumi oksida besi magnetik atau sulfida besi yang dikelilingi oleh lapisan lipid. Ini membolehkan sel menjajarkan sepanjang medan magnet, membantu pergerakannya (Rajah (PageIndex<8>)). Sianobakteria seperti Anabaena cylindrica dan bakteria seperti Halothiobacillus neapolitanus menghasilkan kemasukan karboksisom. Carboxysomes terdiri daripada cangkang luar beribu-ribu subunit protein. Bahagian dalamannya dipenuhi dengan ribulosa-1,5-bifosfat karboksilase / oksigenase (RuBisCO) dan anhidrat karbonik. Kedua-dua sebatian ini digunakan untuk metabolisme karbon. Sesetengah sel prokariotik juga mempunyai karboksisom yang mengasingkan enzim yang berkaitan dengan fungsi di satu lokasi. Struktur ini dianggap proto-organel kerana ia membahagikan sebatian penting atau tindak balas kimia, sama seperti kebanyakan organel eukariotik.


Pemanjangan dan Penamatan

Berikutan pembentukan kompleks prainisiasi, polimerase dibebaskan daripada faktor transkripsi lain, dan pemanjangan dibenarkan untuk diteruskan seperti yang berlaku dalam prokariot dengan polimerase mensintesis pra-mRNA dalam arah 5′ hingga 3′. Seperti yang dibincangkan sebelumnya, RNA polimerase II mentranskripsikan bahagian utama gen eukariotik, jadi bahagian ini akan memberi tumpuan kepada bagaimana polimerase ini mencapai pemanjangan dan penamatan.

Walaupun proses pemanjangan enzimatik pada asasnya sama dalam eukariota dan prokariot, templat DNA adalah lebih kompleks. Apabila sel eukariotik tidak membahagi, gen mereka wujud sebagai jisim DNA dan protein yang tersebar yang disebut kromatin. DNA dibungkus rapat di sekeliling protein histon bercas pada selang waktu berulang. Kompleks DNA-histone ini, secara kolektif dipanggil nukleosom, dijarakkan secara tetap dan termasuk 146 nukleotida DNA yang dililit di sekitar lapan histon seperti benang di sekeliling gelendong.

Untuk sintesis polinukleotida berlaku, jentera transkripsi perlu mengalihkan histon keluar dari jalan setiap kali ia menemui nukleosom. Ini dicapai oleh kompleks protein khas yang dipanggil FAKTA, yang bermaksud & # 8220fasilitasi transkripsi kromatin. & # 8221 Kompleks ini menarik histon dari templat DNA ketika polimerase bergerak di sepanjangnya. Sebaik sahaja pra-mRNA disintesis, kompleks FACT menggantikan histon untuk mencipta semula nukleosom.

Penamatan transkripsi berbeza untuk polimerase yang berbeza. Tidak seperti dalam prokariot, pemanjangan oleh RNA polimerase II dalam eukariota berlaku 1,000-2,000 nukleotida di luar hujung gen yang ditranskripsikan. Ekor pra-mRNA ini kemudiannya dikeluarkan oleh belahan semasa pemprosesan mRNA. Sebaliknya, polimerase RNA I dan III memerlukan isyarat penamatan. Gen yang ditranskripsi oleh RNA polimerase I mengandungi jujukan 18-nukleotida tertentu yang diiktiraf oleh protein penamatan. Proses penamatan dalam polimerase III RNA melibatkan jepit rambut mRNA yang serupa dengan penamatan transkripsi bebas rho di prokariota.


Struktur dan Ciri-Ciri

Dari segi struktur ia kelihatan seperti roti hamburger kecil yang mempunyai dua subunit: yang besar (bun atas) dan yang kecil (bun bawah).

Saiz dan Bentuk

Mereka luar biasa kerana keseragaman saiz dan bentuknya. Ribosom yang terdapat dalam sel tumbuhan dan haiwan yang lebih tinggi adalah berbentuk oblat atau spheroid, mempunyai diameter 150 hingga 200 A 0 . Saiz sebenar ribosom berbeza-beza, bergantung pada jenis sel dan sama ada sel sedang berehat atau mengambil bahagian dalam pembahagian sel. Kedua-dua bentuk bebas dan terikat tidak tertutup membran.

Bahagian dan Komposisinya: Ribosom Diperbuat Daripada Apa

Mereka adalah organel yang terdiri daripada RNA khusus, yang dikenali sebagai RNA ribosom (rRNA) dan berpuluh-puluh protein yang berbeza dan juga dikenali sebagai ribonukleoprotein. Sekitar 37 hingga 62% daripada ribosom terdiri daripada RNA, dan selebihnya adalah protein.

Apabila dilihat di bawah mikroskop elektron, protein ribosom dan rRNA disusun menjadi dua kepingan ribosom berbeza dengan saiz yang berbeza, dikenali secara amnya sebagai subunit besar dan kecil ribosom. Kedua-dua subunit bergabung untuk membentuk organel yang lengkap. Kedua-dua subunit dikelaskan berdasarkan pemalar pemendapan mereka, diukur dalam unit Svedberg (S). Ia menawarkan ialah ukuran kadar pemendapan zarah, berdasarkan saiz, bentuk dan ketumpatannya.

Jenis-Jenis

Berdasarkan pemalar pemendapan subunitnya, ribosom secara meluas dikelaskan kepada dua jenis:

  1. Ribosom Prokariotik (Bakteria): Mempunyai pemalar pemendapan 70S (sama dengan berat molekul 2.7×106 Dalton) dengan subunit kecil 30S dan subunit besar 50S. E coli, sebagai contoh, dengan subunit 30S yang kecil mempunyai subunit RNA 16S yang terdiri daripada 1540 nukleotida yang terikat kepada 21 protein, manakala subunit 50S yang besar terdiri daripada subunit RNA 5S yang mempunyai 120 nukleotida, subunit RNA 23S dengan 2900 nukleotida dan 2900 protein.
  2. Ribosom Eukariotik: Mempunyai ribosom 80S (sama dengan berat molekul 4×106 Dalton) terletak di dalam sitosolnya, setiap satunya terdiri daripada subunit 40S dan 60S yang kecil. Humans, for example, with a small 40S subunit has a 18S RNA having 1900 nucleotides and 33 proteins, while the large 60S subunit is composed of a 5S RNA with 120 nucleotides, 28S RNA with 4700 nucleotides, 5.8S RNA with 160 nucleotides and 46 proteins.

​Common Cell Morphologies and Arrangements

​Individual cells of a particular prokaryotic organism are typically similar in shape, or sel morphology. Although thousands of prokaryotic organisms have been identified, only a handful of cell morphologies are commonly seen microscopically. Figure 2 names and illustrates cell morphologies commonly found in prokaryotic cells. In addition to cellular shape, prokaryotic cells of the same species may group together in certain distinctive arrangements depending on the plane of cell division. Some common arrangements are shown in Figure 3.

Rajah 2. (credit “Coccus” micrograph: modification of work by Janice Haney Carr, Centers for Disease Control and Prevention credit “Coccobacillus” micrograph: modification of work by Janice Carr, Centers for Disease Control and Prevention credit “Spirochete” micrograph: modification of work by Centers for Disease Control and Prevention)

​In most prokaryotic cells, morphology is maintained by the cell wall in combination with cytoskeletal elements. The cell wall is a structure found in most prokaryotes and some eukaryotes it envelopes the cell membrane, protecting the cell from changes in osmotic pressure (Figure 4). Osmotic pressure occurs because of differences in the concentration of solutes on opposing sides of a semipermeable membrane. Water is able to pass through a semipermeable membrane, but solutes (dissolved molecules like salts, sugars, and other compounds) cannot. When the concentration of solutes is greater on one side of the membrane, water diffuses across the membrane from the side with the lower concentration (more water) to the side with the higher concentration (less water) until the concentrations on both sides become equal. This diffusion of water is called osmosis, and it can cause extreme osmotic pressure on a cell when its external environment changes.

The external environment of a cell can be described as an isotonic, hypertonic, or hypotonic medium. In an isotonic medium, the solute concentrations inside and outside the cell are approximately equal, so there is no net movement of water across the cell membrane. In a hypertonic medium, the solute concentration outside the cell exceeds that inside the cell, so water diffuses out of the cell and into the external medium. In a hypotonic medium, the solute concentration inside the cell exceeds that outside of the cell, so water will move by osmosis into the cell. This causes the cell to swell and potentially lyse, or burst.

The degree to which a particular cell is able to withstand changes in osmotic pressure is called tonicity. Cells that have a cell wall are better able to withstand subtle changes in osmotic pressure and maintain their shape. In hypertonic environments, cells that lack a cell wall can become dehydrated, causing crenation, or shriveling of the cell the plasma membrane contracts and appears scalloped or notched (Figure 4). By contrast, cells that possess a cell wall undergo plasmolysis rather than crenation. Dalam plasmolysis, the plasma membrane contracts and detaches from the cell wall, and there is a decrease in interior volume, but the cell wall remains intact, thus allowing the cell to maintain some shape and integrity for a period of time (Figure 5). Likewise, cells that lack a cell wall are more prone to lysis in hypotonic environments. The presence of a cell wall allows the cell to maintain its shape and integrity for a longer time before lysing (Figure 5).

Figure 4. In cells that lack a cell wall, changes in osmotic pressure can lead to crenation in hypertonic environments or cell lysis in hypotonic environments.​


Tonton videonya: Svedberg unit and Ribosome- WHAT u0026 WHY? NOBEL PRIZE 2009. ram mutation (Disember 2022).