Maklumat

Suite Pemprosesan Imej untuk mikroskopi bakteria: Schnitzcells atau MicrobeTracker?

Suite Pemprosesan Imej untuk mikroskopi bakteria: Schnitzcells atau MicrobeTracker?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Saya sedang mencari untuk mula melakukan beberapa kerja menjejak saiz dan pertumbuhan sel bakteria individu dalam mikroskop. Untuk menganalisis imej, saya memerlukan perisian yang boleh membahagikan sel, menentukan bentuknya dengan tepat dan menjejaki keturunan sel pada 'filem' imej yang dikumpulkan daripada satu eksperimen. Memandangkan kekangan persediaan mikroskop saya, perkara paling mudah untuk saya lakukan ialah menggunakan strain bakteria yang secara konstitutif menyatakan GFP dan membahagikan sel berdasarkan intensiti pendarfluor. Ini secara fungsinya bersamaan dengan imej kontras fasa tersegmen sel jenis liar, iaitu saya tidak begitu berminat dengan perubahan dalam pendarfluor atau menggunakan pendarfluor sebagai wartawan ekspresi gen, walaupun keperluan saya mungkin menuju ke arah itu.

Saya tidak mahu mencipta semula roda (dan saya fikir adalah lebih baik jika komuniti menyatukan beberapa program yang digunakan oleh semua orang supaya eksperimen boleh menjadi lebih setanding), jadi saya sedang mencari pakej yang diterbitkan sebelum ini yang mantap dan mudah untuk digunakan. Fleksibiliti dalam mengukur penjejakan pendarfluor adalah bagus, tetapi pada peringkat ini tidak penting. Dua pakej yang saya lihat ialah Schnitzcells dari makmal Elowitz di CalTech dan Microbetracker dari kumpulan Emonet dan Jacobs-Wagner di Yale. Malangnya ia dikeluarkan pada masa yang sama dan tidak memberikan perbandingan yang baik tentang kebaikan/keburukan setiap alat.

Akhirnya, soalan saya ialah

Apakah cadangan anda untuk suite analisis imej (daripada dua pakej di atas atau pakej lain yang telah anda gunakan)?

Beritahu saya jika saya boleh membuat kriteria saya lebih jelas atau apa-apa lagi. Terima kasih!